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王慧1021

金虫 (小有名气)

[求助] lammps 求扩散系数 出错

LAMMPS (7 Jul 2009)
Scanning data file ...
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导! 2013-11-17 11:12:27
王慧1021: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-11-17 23:15:06
引用回帖:
5楼: Originally posted by 王慧1021 at 2013-11-15 19:53:48
我原来用的原子类型是atomic,不用考虑键角等,现在换了气体,需要考虑了...

你得参考一些基本的力场来获得这些参数,比如说OPLS,CHARMM, Amber,google这些力场就可以找到与它们相关的网页或者文献。
6楼2013-11-17 00:09:24
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢应助。 2013-11-15 09:54:42
确定你data文件里的atom部分的行数与你data文件开头的原子数相等?确定你atom部分的格式与你的atom style相符合?

p.s. 你的lammps版本比较旧,建议用新一点的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-11-14 23:54:27
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王慧1021

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2013-11-14 23:54:27
确定你data文件里的atom部分的行数与你data文件开头的原子数相等?确定你atom部分的格式与你的atom style相符合?

p.s. 你的lammps版本比较旧,建议用新一点的。

请问bond_coeff  和 angle_coeff参数怎么求呢
3楼2013-11-15 18:27:40
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

★ ★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-16 13:38:15
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-16 16:45:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 王慧1021 at 2013-11-14 22:27:40
请问bond_coeff  和 angle_coeff参数怎么求呢...

这些参数难道不已经在in或者data文件里输入了?
4楼2013-11-16 03:45:13
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