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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】运行并行版的DL_POLY的时候，出现的问题
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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】运行并行版的DL_POLY的时候，出现的问题

当我在终端输入mpirun的时候，出现:
/opt/intel/composerxe-2011.1.107/mpirt/bin/ia32/mpirun: line 86: /opt/intel/composerxe-2011.1.107/mpirt/bin/ia32/mpivars.sh: No such file or directory
WARNING: Unable to read mpd.hosts or list of hosts isn't provided. MPI job will be run on the current machine only.
但是我which mpirun,which mpiexec,which mpicxx...都是可以的
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1楼 2011-01-10 18:31:04
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winterz

木虫 (小有名气)
★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-18 17:03:52
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-10 18:31:04:
当我在终端输入mpirun的时候，出现:
/opt/intel/composerxe-2011.1.107/mpirt/bin/ia32/mpirun: line 86: /opt/intel/composerxe-2011.1.107/mpirt/bin/ia32/mpivars.sh: No such file or directory
WARNING: U ...

你在使用mpirun的时候没有启动mpd吧。
先执行一下“mpd &”命令试试。
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2楼2011-01-10 19:11:20
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by winterz at 2011-01-10 19:11:20:


你在使用mpirun的时候没有启动mpd吧。
先执行一下“mpd &”命令试试。

用了这个，还是不行，是不是我用的mpi有问题，我用的是mpich2
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3楼2011-01-10 19:44:05
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winterz

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-11 22:39:31
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-11 22:39:45
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-10 19:44:05:

用了这个，还是不行，是不是我用的mpi有问题，我用的是mpich2

我用的是openmpi，不然你装这个试试。另外，计算平台和网络配置也可能有一定影响，你用的是集群还是PC机，Linux使用的哪个发行版？网络是ethernet还是infiniband？
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4楼2011-01-10 20:02:36
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tangbohejin

木虫之王 (文学泰斗)
★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
学习一下-----
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5楼2011-01-10 20:06:33
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by winterz at 2011-01-10 20:02:36:


我用的是openmpi，不然你装这个试试。另外，计算平台和网络配置也可能有一定影响，你用的是集群还是PC机，Linux使用的哪个发行版？网络是ethernet还是infiniband？

我用的就是PC机，网络就是以太网，可能是ifort装好后，就没有那个脚本文件，我在终端里面只能使用mpiexec.
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6楼2011-01-10 20:12:47
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winterz

木虫 (小有名气)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-11 22:39:40
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-10 20:12:47:

我用的就是PC机，网络就是以太网，可能是ifort装好后，就没有那个脚本文件，我在终端里面只能使用mpiexec.

我觉得这个与ifort关系应该不大，主要是mpi的问题，把mpich2重装一下，再编译好dlpoly的并行版。


mpd &
mpirun -np 4 DLPOLY.X_mpi
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7楼2011-01-10 20:37:27
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我不是陈冠希

铜虫 (小有名气)
★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
不太清楚噢
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2386813&fpage=1
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8楼2011-01-10 22:17:14
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byin

铜虫 (正式写手)
★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-18 17:04:14
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-10 18:31:04:
当我在终端输入mpirun的时候，出现:
/opt/intel/composerxe-2011.1.107/mpirt/bin/ia32/mpirun: line 86: /opt/intel/composerxe-2011.1.107/mpirt/bin/ia32/mpivars.sh: No such file or directory
WARNING: U ...

楼主您好，不知道您的问题解决了没有。
我在运行vasp的时候也遇到了同样的问题。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2986831
而且也是装了ifort之后就没有mpivar.sh，其他的mpd，mpirun等等一切正常。不知道哪里出错了，还请多多指教。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2011-04-18 15:27:56
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