24小时热门版块排行榜    

查看: 1907  |  回复: 5

王慧1021

金虫 (小有名气)

[求助] lammps 求扩散系数 出错

LAMMPS (7 Jul 2009)
Scanning data file ...
ERROR on proc 0: Unknown identifier in data file: 1920  0  6  0.125  19.374  6.458  11.5262
rank 0 in job 1  buct-mnode09_44350   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢应助。 2013-11-15 09:54:42
确定你data文件里的atom部分的行数与你data文件开头的原子数相等?确定你atom部分的格式与你的atom style相符合?

p.s. 你的lammps版本比较旧,建议用新一点的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-11-14 23:54:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王慧1021

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2013-11-14 23:54:27
确定你data文件里的atom部分的行数与你data文件开头的原子数相等?确定你atom部分的格式与你的atom style相符合?

p.s. 你的lammps版本比较旧,建议用新一点的。

请问bond_coeff  和 angle_coeff参数怎么求呢
3楼2013-11-15 18:27:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

★ ★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-16 13:38:15
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-16 16:45:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 王慧1021 at 2013-11-14 22:27:40
请问bond_coeff  和 angle_coeff参数怎么求呢...

这些参数难道不已经在in或者data文件里输入了?
4楼2013-11-16 03:45:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王慧1021

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lsloneil at 2013-11-16 03:45:13
这些参数难道不已经在in或者data文件里输入了?...

我原来用的原子类型是atomic,不用考虑键角等,现在换了气体,需要考虑了
5楼2013-11-16 15:53:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导! 2013-11-17 11:12:27
王慧1021: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-11-17 23:15:06
引用回帖:
5楼: Originally posted by 王慧1021 at 2013-11-15 19:53:48
我原来用的原子类型是atomic,不用考虑键角等,现在换了气体,需要考虑了...

你得参考一些基本的力场来获得这些参数,比如说OPLS,CHARMM, Amber,google这些力场就可以找到与它们相关的网页或者文献。
6楼2013-11-17 00:09:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 王慧1021 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] [复试调剂]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +3 张vvvv 2026-03-15 5/250 2026-03-16 20:25 by 张vvvv
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +5 d如愿上岸 2026-03-12 8/400 2026-03-16 15:19 by peike
[考研] 309求调剂 +5 花与叶@ 2026-03-10 5/250 2026-03-16 14:13 by 哦哦123
[考研] 326求调剂 +4 上岸的小葡 2026-03-15 5/250 2026-03-16 08:39 by Linda Hu
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 一志愿安徽大学材料工程专硕313分,求调剂的学校 +8 Yu先生 2026-03-10 10/500 2026-03-14 01:04 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
请填处理意见