24小时热门版块排行榜    

查看: 1034  |  回复: 18
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiaomeng12

银虫 (正式写手)

[求助] DNA测序

请问如果对微生物中(有来自两个地区的标本)某一蛋白进行sanger测序,得到的结果可以分析哪些东西?有没有人在在做DNA测序方面的工作?求指教。

[ Last edited by xiaomeng12 on 2013-10-19 at 10:56 ]
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaomeng12

银虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wcfbio at 2013-10-20 14:11:07
可以的用DNAstar和DNAman都可以翻译成氨基酸序列,然后再NCBI BLASTP,检索出相似的序列,然后就可以用clustalw等软件进行多重序列的比对了。...

那请问我测序前的前期工作中,需要提取细菌基因组DNA,那你知不知道什么试剂盒比较好?可不可以直接从菌株保藏液(含甘油)直接提取,还是需要重新在平板上培养?
9楼2013-10-20 15:44:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaomeng12: 金币+5, 有帮助 2013-10-19 14:27:58
单纯只测一个蛋白的基因序列的 只能做一点分析, 比如和其他的蛋白的同源性。你是想要得到什么信息?
2楼2013-10-19 14:01:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaomeng12

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-10-19 14:01:18
单纯只测一个蛋白的基因序列的 只能做一点分析, 比如和其他的蛋白的同源性。你是想要得到什么信息?

我测一种细菌中3种具有毒性的蛋白质的序列,可以和genbank上已经公布的序列进行比对,或者其他一些分析。可否告知具体分析的软件或者根据公司的测序结果可以做出什么分析?测序基因的大小大概是2000多bp,一般都用sanger测序吗?
3楼2013-10-19 14:31:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xiaomeng12: 金币+5, 有帮助 2013-10-19 21:32:31
直接 blast, 或者把你想对比的序列下载下来 用clusterw 和 tree view 来对比建树都行。 现在这种单基因测序都还是用sanger
4楼2013-10-19 19:48:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 3/150 2026-08-22 22:03 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见