24小时热门版块排行榜    

查看: 1032  |  回复: 18
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiaomeng12

银虫 (正式写手)

[求助] DNA测序

请问如果对微生物中(有来自两个地区的标本)某一蛋白进行sanger测序,得到的结果可以分析哪些东西?有没有人在在做DNA测序方面的工作?求指教。

[ Last edited by xiaomeng12 on 2013-10-19 at 10:56 ]
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wcfbio

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiaomeng12: 金币+10, 有帮助 2013-10-21 08:21:32
xiaomeng12: 金币+10, 有帮助 2013-10-21 22:49:44
我们实验室用的天根的提基因组试剂盒,不过也不是所有的细菌都适合用试剂盒法,有的用CTAB法提的比试剂盒要好,我们一般试剂盒提不出来的用CTAB法提,甘油保种的可以提,但是菌体可能有点少,我们一般都是接到液体培养基活化后在提,划在固体平板上可以挑菌落去提DNA。我的建议是先接到液体培养基里面活化6-10 个小时左右,然后涂在固体的LB平板上面,挑单菌落,纯化两次左右,然后再挑菌落接种到LB液体培养基里面培养12-16h,离心菌体,提基因组。
对于誓言一定要实现。
10楼2013-10-20 16:04:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaomeng12: 金币+5, 有帮助 2013-10-19 14:27:58
单纯只测一个蛋白的基因序列的 只能做一点分析, 比如和其他的蛋白的同源性。你是想要得到什么信息?
2楼2013-10-19 14:01:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaomeng12

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-10-19 14:01:18
单纯只测一个蛋白的基因序列的 只能做一点分析, 比如和其他的蛋白的同源性。你是想要得到什么信息?

我测一种细菌中3种具有毒性的蛋白质的序列,可以和genbank上已经公布的序列进行比对,或者其他一些分析。可否告知具体分析的软件或者根据公司的测序结果可以做出什么分析?测序基因的大小大概是2000多bp,一般都用sanger测序吗?
3楼2013-10-19 14:31:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eagles123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xiaomeng12: 金币+5, 有帮助 2013-10-19 21:32:31
直接 blast, 或者把你想对比的序列下载下来 用clusterw 和 tree view 来对比建树都行。 现在这种单基因测序都还是用sanger
4楼2013-10-19 19:48:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +7 羊腰板 2026-08-21 7/350 2026-08-21 21:28 by iwuli
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 14/700 2026-08-21 16:51 by applepetty
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +15 archvillain 2026-08-15 27/1350 2026-08-21 11:32 by tim76
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +15 kkkl_v 2026-08-19 16/800 2026-08-21 11:22 by 365372687
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
信息提示
请填处理意见