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dulei

木虫 (小有名气)

[求助] 提取霉菌基因组总是有细菌基因组污染,怎么办?

曲霉,用液氮研磨法提取基因组,提取出来后用细菌16sRNA引物检测,总是能P出细菌大小的条带。如果是纯的曲霉基因组,不应该扩增出条带才对。
之后,养霉菌的时候加入了卡那、氨苄、氯霉素3种抗生素,防止细菌污染,从长的情况来看,应该是没有细菌污染,可是提取完基因组,做PCR验证,还是有细菌基因组污染。
我要做基因组测序,提出基因组后要给公司,必须要求纯的基因组,如何去除细菌基因组的污染?

急求大神。
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pan2qfly

新虫 (小有名气)

请问题主解决了吗?
2楼2021-04-19 19:03:35
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ymj002

木虫 (小有名气)

细菌无处不在,PCR又太灵敏,要完全分开不现实。基因组测序后要组装的,一般不会搞混的

发自小木虫Android客户端
3楼2021-04-21 13:27:22
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4楼2021-04-22 10:55:25
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