24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1642  |  回复: 4

cg陈

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 关于MS动力学精度设置问题

跑一个动力学任务,离不开对非键作用的设置,对于vdw作用可以使用cutoff,设置小于盒子尺寸的一半,对于静电作用,用的比较多的是Ewald。
问题就是这个Ewald精度到底该如何选择?
抛砖引玉:假设有一个含有200个分子的体系,盒子尺寸大概是30X30X20,cutoff选择9.5,Ewald精度该选择多少呢?MS此时默认为0.01。
MS默认精度是5000,体系温度是298K,是不是通过约化能量公式,设置Ewald精度使得体系平衡时能量随时间比在5%内,也就是0.0001?
向大家请教,该如何理清呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

管理员

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

顶一下  希望有人来讨论呀
2楼2013-10-14 08:26:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c25968

主管区长

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cg陈: 金币+2, 有帮助 2013-10-14 09:24:45
你可以把几个精度都试试 然后看看计算结果又什么区别
3楼2013-10-14 08:33:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
3楼: Originally posted by c25968 at 2013-10-14 08:33:05
你可以把几个精度都试试 然后看看计算结果又什么区别

嗯 精度测试肯定是要做的

有没有Ewald精度选择的理论判据呀?
4楼2013-10-14 09:26:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

siyecao0425

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用MS5.0中的DPD模块对所划分的珠子大小没有区分,但是实际上珠子的差别很大,那请问怎样能减小误差,或者来解释这一问题,希望各位高手指点迷津,感激不尽!
5楼2013-10-15 08:34:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cg陈 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 308求调剂 +12 墨墨漠 2026-03-25 12/600 2026-04-01 01:42 by 1018329917
[考研] 一志愿085600中科院宁波所276分求调剂 +16 材料学257求调剂 2026-03-28 17/850 2026-04-01 01:32 by 1018329917
[考研] 359求调剂 +7 邓邓邓书书 2026-03-25 7/350 2026-03-31 23:15 by fs26jie
[考研] 调剂申请 +7 张张张张zy 2026-03-31 7/350 2026-03-31 22:25 by piaoyi415
[考研] 一志愿:西北大学,英一数一408-284分求调剂 +7 12.27 2026-03-27 7/350 2026-03-31 21:59 by lbsjt
[考研] 284求调剂 +9 小熊~~ 2026-03-31 9/450 2026-03-31 18:22 by 253863592
[考研] 考研生物与医药调剂 +6 铁憨憨123425 2026-03-31 6/300 2026-03-31 17:48 by 544594351
[考研] 生医工0831调剂求推荐 +4 小熊睿睿_s 2026-03-27 6/300 2026-03-31 17:12 by 记事本2026
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +6 hanamiko 2026-03-29 6/300 2026-03-31 16:35 by hypershenger
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
[考研] 282求调剂 +3 呼吸都是减肥 2026-03-31 3/150 2026-03-31 10:00 by wangjy2002
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
[考研] 303求调剂 +7 DLkz1314. 2026-03-30 7/350 2026-03-30 21:07 by peike
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 296求调剂 +10 彼岸t 2026-03-29 10/500 2026-03-30 10:50 by 探123
[考研] 337求调剂 +6 《树》 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:15 by herarysara
[考研] 2026年华南师范大学欢迎化学,化工,生物,生医工等专业优秀学子加入! +3 llss0711 2026-03-28 6/300 2026-03-29 10:26 by llss0711
[考研] 压国家一区线,求导师收留,有恩必谢! +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 一志愿上海理工能源动力(085800)310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
信息提示
请填处理意见