24小时热门版块排行榜    

查看: 1116  |  回复: 5

pllyf2006

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】关于oniom计算的bsse问题 已有1人参与

我优化一个oniom分子筛,内层12T用B3LYP/6–31+G(d, p),外层用UFF,在这个模型上吸附一个过渡元素原子,过渡元素用 LANL2DZ,优化完成后怎么计算bsse,望高人指点,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

pllyf2006(金币+1): 2010-10-27 12:41:22
bsse矫正论坛上以前好像有人讨论过,你去看看
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
2楼2010-10-27 12:11:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pllyf2006

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2010-10-27 12:11:47:
bsse矫正论坛上以前好像有人讨论过,你去看看

就是看了好多不明白啊,有高人就直接帮帮忙吧
3楼2010-10-27 12:41:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ybyygu

铁杆木虫 (小有名气)

pllyf2006(金币+3): 2010-10-27 21:04:43
pllyf2006(金币+6): 2011-01-08 16:37:59
截出高层模型单独做BSSE, 这和普通簇的校正一样了. 也可以依照ONIOM原理, 用外推的方式加减. 但根据经验, 第一种方法实际上精度已经足够了.
4楼2010-10-27 17:07:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pllyf2006

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by ybyygu at 2010-10-27 17:07:34:
截出高层模型单独做BSSE, 这和普通簇的校正一样了. 也可以依照ONIOM原理, 用外推的方式加减. 但根据经验, 第一种方法实际上精度已经足够了.

谢谢你啊,还需要再请教一下.依照ONIOM原理,用外推的方式加减,怎么处理啊,能说的详细点吗,谢谢。

[ Last edited by pllyf2006 on 2010-10-27 at 22:33 ]
5楼2010-10-27 21:36:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ybyygu

铁杆木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by pllyf2006 at 2010-10-27 21:36:43:

谢谢你啊,还需要再请教一下.依照ONIOM原理,用外推的方式加减,怎么处理啊,能说的详细点吗,谢谢。

[ Last edited by pllyf2006 on 2010-10-27 at 22:33 ]

E(ONIOM2) = E(Model, High) + E(Real, Low) - E(Model, Low)
其中E(Real, Low) - E(Model, Low)是使用Low方法对E(Model, High)的外推校正, Low越接近于High, 这种外推效果越好. 但有点要注意, 虽然原始公式里E指的是绝对能量, 但Morokuma的文章里多次指出, E为相对能量(吸附热, 反应能垒, 甚至BSSE等)这种外推才有意义. 也就是ONIOM外推算法不适用于绝对能量, 只在相对能量上表现良好(也可以说是对能量的梯度, 因此优化构型还好). 对于大簇的BSSE, 你可以套用同样的公式来处理, 即将公式里的E换成BSSE. BSSE(Model, High)相当于高层模型用高方法计算出的BSSE, 后面两项相当于用Low方法替换high来求当体系由Model扩大为Real时BSSE的变化值. 我以前测试过, 后两项之差非常接近于零, 当然这也依赖于高低层区域的划分, 以及低层方法的选取. 你的外层方法如果选UFF, 后两项大可不必求了.

[ Last edited by ybyygu on 2011-1-12 at 09:41 ]
6楼2011-01-12 09:35:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pllyf2006 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +14 爱看书的可乐 2026-08-26 16/800 2026-08-26 18:28 by skyjudy
[基金申请] 我不理解! +9 Edward_pc 2026-08-26 14/700 2026-08-26 18:03 by hsding2026
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +3 晴天加油 2026-08-26 4/200 2026-08-26 17:59 by Tide man
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见