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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】关于oniom计算的bsse问题
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pllyf2006

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】关于oniom计算的bsse问题 已有1人参与

我优化一个oniom分子筛，内层12T用B3LYP/6–31+G(d, p)，外层用UFF，在这个模型上吸附一个过渡元素原子，过渡元素用 LANL2DZ，优化完成后怎么计算bsse，望高人指点，谢谢
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1楼 2010-10-27 10:47:05
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
pllyf2006(金币+1): 2010-10-27 12:41:22
bsse矫正论坛上以前好像有人讨论过，你去看看
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
2楼2010-10-27 12:11:47
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pllyf2006

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2010-10-27 12:11:47:
bsse矫正论坛上以前好像有人讨论过，你去看看

就是看了好多不明白啊，有高人就直接帮帮忙吧
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3楼2010-10-27 12:41:15
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ybyygu

铁杆木虫 (小有名气)
pllyf2006(金币+3): 2010-10-27 21:04:43
pllyf2006(金币+6): 2011-01-08 16:37:59
截出高层模型单独做BSSE, 这和普通簇的校正一样了. 也可以依照ONIOM原理, 用外推的方式加减. 但根据经验, 第一种方法实际上精度已经足够了.
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4楼2010-10-27 17:07:34
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pllyf2006

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ybyygu at 2010-10-27 17:07:34:
截出高层模型单独做BSSE, 这和普通簇的校正一样了. 也可以依照ONIOM原理, 用外推的方式加减. 但根据经验, 第一种方法实际上精度已经足够了.

谢谢你啊，还需要再请教一下.依照ONIOM原理，用外推的方式加减，怎么处理啊，能说的详细点吗，谢谢。

[ Last edited by pllyf2006 on 2010-10-27 at 22:33 ]
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5楼2010-10-27 21:36:43
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ybyygu

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by pllyf2006 at 2010-10-27 21:36:43:

谢谢你啊，还需要再请教一下.依照ONIOM原理，用外推的方式加减，怎么处理啊，能说的详细点吗，谢谢。

[ Last edited by pllyf2006 on 2010-10-27 at 22:33 ]

E(ONIOM2) = E(Model, High) + E(Real, Low) - E(Model, Low)
其中E(Real, Low) - E(Model, Low)是使用Low方法对E(Model, High)的外推校正, Low越接近于High, 这种外推效果越好. 但有点要注意, 虽然原始公式里E指的是绝对能量, 但Morokuma的文章里多次指出, E为相对能量(吸附热, 反应能垒, 甚至BSSE等)这种外推才有意义. 也就是ONIOM外推算法不适用于绝对能量, 只在相对能量上表现良好(也可以说是对能量的梯度, 因此优化构型还好). 对于大簇的BSSE, 你可以套用同样的公式来处理, 即将公式里的E换成BSSE. BSSE(Model, High)相当于高层模型用高方法计算出的BSSE, 后面两项相当于用Low方法替换high来求当体系由Model扩大为Real时BSSE的变化值. 我以前测试过, 后两项之差非常接近于零, 当然这也依赖于高低层区域的划分, 以及低层方法的选取. 你的外层方法如果选UFF, 后两项大可不必求了.

[ Last edited by ybyygu on 2011-1-12 at 09:41 ]
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6楼2011-01-12 09:35:44
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