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weilihua0701

金虫 (小有名气)

[求助] 晶体文件中氢键信息怎么看

本人刚接触晶体,对tex中的氢键信息看不懂,比如
D-H           d(D-H)   d(H..A)   <DHA    d(D..A)   A

O7-H7B         0.850    2.688   160.09    3.499    Br1
这是什么意思,只知道D是donator,A是acceptance,其余的是什么意思?
请各位大神不吝赐教!本人不甚感激!
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weilihua0701

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huanyys at 2013-10-10 23:33:53
这两个字母你知道什么意思,就很容易啦。那个D就是与氢原子相连的那个原子,这个原子和氢原子以化学键相连,都属于提供氢的那个分子。另外的A就是与氢原子靠作用力相连的原子,应该是另外一个分子中的原子。他们之间 ...

谢谢楼上的详细解释!谢谢!
3楼2013-10-11 08:31:32
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huanyys

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
weilihua0701: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 解释的很详细,谢谢! 2013-10-11 08:31:07
这两个字母你知道什么意思,就很容易啦。那个D就是与氢原子相连的那个原子,这个原子和氢原子以化学键相连,都属于提供氢的那个分子。另外的A就是与氢原子靠作用力相连的原子,应该是另外一个分子中的原子。他们之间形成的氢键。
d(D-H)=0.850 d(H..A)=2.688 都是说氢原子到这两个原子的距离
<DHA=160.09 是说这D-H和 H..A 这两个键形成的角度
d(D..A) 则是这两个分子中与氢相连的原子的距离
也就是说 这个氢键应该是 O7-H7B.. Br1 这样构成的。
2楼2013-10-10 23:33:53
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