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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助大家帮把这两个晶体的的氢键表和对称代码生成一下
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wzq70402

捐助贵宾 (小有名气)

[求助] 求助大家帮把这两个晶体的的氢键表和对称代码生成一下

求助大家帮把这两个晶体的的氢键表 包括传统氢键和非传统氢键，和对称代码生成一下，在下不太会用shelx，谢谢了！
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    • 2013-09-23 00:36:03, 3.73 M

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海内存知已
1楼 2013-09-23 00:38:13
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wzq70402: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢，采纳了 2013-09-23 10:41:24
SS1
1 Intra 1 C(7)  --H(7)   ..O(2)   [         ]       0.93       2.37   3.078(7)        132
2 Intra 1 C(11) --H(11)  ..O(1)   [         ]       0.98       2.26   2.734(6)        108
3       1*C(22B)--H(22C) ..Br     [  1655.01]       0.97       2.90    3.59(2)        129
4       1 C(32) --H(32B) ..O(2)   [  4556.01]       0.96       2.25  3.172(11)        160

:: No Classic Hydrogen Bonds Found


Translation of ARU-code to Equivalent Position Code
===================================================
   [  4556. ]  = -x,1/2+y,3/2-z
   [  1655. ]  = 1+x,y,z


Sr1

1       1 C(1)  --H(1)   ..O(4)   [  4646.01]       0.95       2.55   3.379(7)        146
2 Intra 1 C(7)  --H(7)   ..O(3)   [         ]       0.95       2.22   3.000(6)        139
3 Intra 1 C(11) --H(11)  ..O(1)   [         ]       1.00       2.26   2.771(6)        110
4 Intra 1 C(18) --H(18)  ..N(3)   [         ]       1.00       2.55   3.287(6)        131

:: No Classic Hydrogen Bonds Found


Translation of ARU-code to Equivalent Position Code
===================================================
   [  4646. ]  = 1-x,-1/2+y,3/2-z
自己编辑到氢键表格当中吧。
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2楼2013-09-23 09:32:16
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wzq70402

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ljmmarise at 2013-09-23 09:32:16
SS1
1 Intra 1 C(7)  --H(7)   ..O(2)          0.93       2.37   3.078(7)        132
2 Intra 1 C(11) --H(11)  ..O(1)          0.98       2.26   2.734(6)        108
3       1*C(22B)--H(22C) ..Br    ...

请问这些氢键是通过diamond生成的吗，还是xp生成的，我担心diamond生成的不准确
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海内存知已
3楼2013-09-24 17:43:10
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)
platon
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wzq70402
4楼2013-09-24 23:46:24
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wzq70402

捐助贵宾 (小有名气)
送红花一朵
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4楼: Originally posted by ljmmarise at 2013-09-24 23:46:24
platon

好的，谢谢
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海内存知已
5楼2013-09-24 23:49:31
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wzq70402

捐助贵宾 (小有名气)
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2楼: Originally posted by ljmmarise at 2013-09-23 09:32:16
SS1
1 Intra 1 C(7)  --H(7)   ..O(2)          0.93       2.37   3.078(7)        132
2 Intra 1 C(11) --H(11)  ..O(1)          0.98       2.26   2.734(6)        108
3       1*C(22B)--H(22C) ..Br    ...

您好，有几个问题想请教您一下
1、我看氢键表中有许多非传统分子内C-H-O氢键，一般文件中都不提这种氢键，所以我有点不知如何处理这种氢键，我文章中可以不写这种氢键吗？
2、我用diamond画了很长时间觉得不好，不知为什么，我用POV-RAY画完后总是无法显示氢键，您方便的话帮我画一下，最近发文章这个难住了，没有学过晶体，自己摸索， 能帮我把这两个晶体的堆积图画一下吗，最好是能把其中是氢键显示出来，
3、我的晶体结构主要是靠范德华力稳定，还有一些pi-pi堆积，这个堆积不知如何通过晶体堆积图表现出来？不太会分析这些信息，您方便的话请赐教指导，麻烦您了
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海内存知已
6楼2013-09-25 09:50:11
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)
画这种c-H...pi, pi...pi, c-H...O图很花时间的，自己慢慢弄吧。
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7楼2013-09-26 10:17:20
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wzq70402

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by ljmmarise at 2013-09-26 10:17:20
画这种c-H...pi, pi...pi, c-H...O图很花时间的，自己慢慢弄吧。

嗯，好吧，总之谢谢你了！
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海内存知已
8楼2013-09-26 13:48:39
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