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wyw3785492

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】找氢键 已有4人参与

各位好,今天我想请教的是,我结构解完后在lst文件中只看到一个氢键,但应该不止一种,我想请教大家我怎么去找lst文件里没有的氢键以及其键长键角,具体用什么软件?怎么操作?
谢谢大家。
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸


yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-14 11:31:57
wyw3785492(金币+10): 2010-07-14 20:29:58
wyw3785492(金币+5):谢谢 2010-07-14 20:30:28
可以在Platon中计算得到经典与非经典的氢键,然后会自动产生氢键列表,可以在xp中找出这些氢键的对称码(Platon中也产生对称码,但是一般与XP中的不同),然后再INS文件中加入EQIV对称码,HTAB氢键给体 受体——对称码,运行XL即可。
2楼2010-07-14 10:20:41
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wyw3785492

金虫 (小有名气)

plant软件怎么用啊?
3楼2010-07-14 10:57:02
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gq1017

金虫 (正式写手)

wyw3785492(金币+5):谢谢 2010-07-14 20:30:17
导入cif   publish   CALC ALL  这样生成的lst里,可以找到你要的东东
4楼2010-07-14 11:36:55
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸

引用回帖:
Originally posted by wyw3785492 at 2010-07-14 10:57:02:
plant软件怎么用啊?

直接选用INS文件,analysis---HADD就可了,自动产生氢键列表。
5楼2010-07-14 13:08:45
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wyw3785492

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gq1017 at 2010-07-14 11:36:55:
导入cif   publish   CALC ALL  这样生成的lst里,可以找到你要的东东

找到氢键了,那我怎么计算对称码?谢谢
6楼2010-07-14 15:17:03
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wyw3785492

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yunruirui at 2010-07-14 13:08:45:

直接选用INS文件,analysis---HADD就可了,自动产生氢键列表。

plant 里没有analysis这个选项。。。。。。。。。
7楼2010-07-14 15:21:08
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸

引用回帖:
Originally posted by wyw3785492 at 2010-07-14 15:21:08:

  
plant 里没有analysis这个选项。。。。。。。。。

是吗,我用的是WinGx,里面的Platon,你再找下肯定可以的,
8楼2010-07-14 15:22:39
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wyw3785492

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yunruirui at 2010-07-14 15:22:39:

是吗,我用的是WinGx,里面的Platon,你再找下肯定可以的,

我用6楼的方法找到了氢键,可是又没有对称码,怎么办呢?谢谢
9楼2010-07-14 15:25:32
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wyw3785492

金虫 (小有名气)

然后再INS文件中加入EQIV对称码,HTAB氢键给 ... [/quote]
不好意思,我想问问在ins文件的那里加这个EQIV,HTAB?具体是什么?第一次涉及,很郁闷。谢谢
10楼2010-07-14 20:33:54
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