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新虫 (初入文坛)

[求助] 如何制作RNA二级结构图 已有1人参与

有RNA序列,请问利用什么软件制作RNA二级结构图,最近要用,谢谢各位大神帮忙!!!
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pillow_milk

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

RNA structure如果是64位的电脑建议使用4.6版的,3.5版的不能兼容。基本步骤(我用来检测单链的)①转化序列 利用Word将待测序列格式转为大写②打开软件RNA structure , File菜单选择new sequence,title处输入改序列的名称,comment处输入single positive-strand RNA,然后在Sequence框内粘贴大写的待测序列,点击format(3.5版需此步骤,4.6版已经自动整理)③保存序列 file菜单处选择Save Sequence④选择Fold RNA折叠序列 选择start,当折叠完成选择Draw structures⑤输出结构
4楼2014-10-08 15:21:45
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雙子の殇

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-30 22:29:00
mfold可以吧,只用过这个,我是在知道是怎样的二级结构后用这个做的,你可以试试

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-09-12 00:24:10
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-09-30 22:29:20
随便下载了个RNA structure就用了
不过大多时候比较懒,直接用这个网站:http://www.idtdna.com/UNAFold?
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
3楼2013-09-12 01:59:51
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