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小雨莎莎

木虫 (正式写手)

[求助] 请教如何进行多肽与蛋白结合的过程中,多肽上关键氨基酸的预测?

请教一下各位虫友,不知道有没有做过蛋白或者多肽结构运算或者是预测的,我现在筛选到一条多肽,只有十来个氨基酸,完全是随机序列,没有cys来固定一个闭合环。这个多肽能够与一个特定的靶蛋白结合,然后我想做改造,希望能优化它与靶点的结合情况比如说想增强亲和力,想提高其生理功能,考虑想要预测一下或者计算模拟一下在这十五个氨基酸中,哪些氨基酸是对结合有很重要的作用的,请问该怎么做呢?有没有什么软件,还是说需要通过做生物信息学研究的老师帮忙才能做出来?谢谢!
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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小雨莎莎: 金币+2, 有帮助, 谢谢关注! 2013-09-05 09:33:47
你就多肽本身?这个很难形成结构啊。
我以前做过phage display,就是用随机库来筛选的。多肽结构在噬菌体上展现
5楼2013-09-05 06:00:49
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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★ ★ ★ ★ ★
小雨莎莎: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢! 2013-09-05 21:21:27
内容已删除
7楼2013-09-05 19:43:09
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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★ ★
小雨莎莎: 金币+2, 有帮助, 3Q 2013-09-06 09:17:14
引用回帖:
8楼: Originally posted by 小雨莎莎 at 2013-09-05 21:21:16
有没有必要请生物信息学的同学来帮忙啊~...

当然可以,不过不要抱太大希望。
10楼2013-09-06 07:47:11
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