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26号

新虫 (初入文坛)

[求助] srap引物筛选

俺是这个月才开始做分子实验的,毕业论文就是做遗传多样性。对于srap引物筛选的流程不是很清楚,也请教过一些师兄师姐,意见不一。(1)有的说可以先找一个固定的pcr体系来筛选几对引物,筛选出较好的引物后,利用这几对引物来重新筛选出一个很好的pcr体系,利用完善的pcr体系再去筛选500多对引物。(2)先用一对或者两对引物来设计筛选完善的pcr体系,再利用这个体系来筛选500多对引物。
    实践出真知,俺就用了第一种方法,同一份DNA,找了一个近缘科的pcr体系,用了5对引物,但是只有一对引物出现条带,觉得有点郁闷,究竟是什么原因呢?是引物的问题?还是pcr体系的问题?还是DNA样本有问题?srap引物不是通用引物麽,应该5对都可以p出来一点点吧,就是什么都没有,为什么呢?
     另外,请问各位大虾高手,俺看到有文献是用ISSR来做俺的那个植物的,请问,俺用srap引物的话,pcr体系跟其一样有木有问题呢?因为引物不一样,退火温度也就不一样了。
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