应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » SSR分子标记的时候为什么部分DNA不能跑出来
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
121/2返回列表12下一页
查看: 1826  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

forgive09

新虫 (初入文坛)

[求助] SSR分子标记的时候为什么部分DNA不能跑出来

本人在做苦瓜SSR的分子标记，但是几次过后，总是有部分DNA的条带不能跑出来，现在我用的是6%聚丙烯酰胺在跑电泳。电压是300V，跑的时间3个小时。到底是体系没有优化好呢，还是其他的什么问题呢？版里谁做过SSR标记的给我支个招，看看我做的苦瓜SSR的分子标记问题出在哪里，给点参考建议，我下面该如何是好？不胜感激

20130320C11FC11R(27~47).jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-21 00:11:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

qapollo

金虫 (小有名气)
forgive09: 回帖置顶 2013-03-22 22:41:12
引用回帖:
4楼: Originally posted by forgive09 at 2013-03-21 22:58:19
但是用不同引物有时候就能全部扩增出条带？这是体系的问题么？谢谢...

有可能是体系的问题
赞一下 回复此楼
6楼2013-03-22 09:04:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

恕我直言，你的问题就很含糊。一个个体出现多少条带并没有一定的，尤其是SSR这种短串联标记，这就是所谓个体差异。不是说每个个体都会出现预期的条带。如果motif=2，片段差2个碱基在凝胶你基本分析不出来。用SSR标记最好的检验方法是荧光标记因无，通过genescan才是分辨的最好方法，使用凝胶分析只是看个皮毛，粗略掌握以下Locus的多态性。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

forgive09
将相本无种★男儿当自强
7楼2013-03-23 14:50:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

qapollo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可能是样品dna质量不高；有的泳道连引物二聚体都没有，所以也可能是扩增时候加的不准。再试几次，如果重复的效果还不是很好可以考虑重新提dna。当然也不是所有的样品都能有很好的条带，实在做不出来就算了，不要在一棵树上吊死。
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-21 11:21:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
跑之前把缓冲液冻成冰块，跑得时候放进缓冲液降温，希望对你有帮助。
从胶图上看不出什么问题。不知道你困扰在什么地方。
祝好
赞一下 回复此楼
将相本无种★男儿当自强
3楼2013-03-21 14:15:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forgive09

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qapollo at 2013-03-21 11:21:19
可能是样品dna质量不高；有的泳道连引物二聚体都没有，所以也可能是扩增时候加的不准。再试几次，如果重复的效果还不是很好可以考虑重新提dna。当然也不是所有的样品都能有很好的条带，实在做不出来就算了，不要在一 ...

但是用不同引物有时候就能全部扩增出条带？这是体系的问题么？谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-21 22:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forgive09

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-03-21 14:15:13
跑之前把缓冲液冻成冰块，跑得时候放进缓冲液降温，希望对你有帮助。
从胶图上看不出什么问题。不知道你困扰在什么地方。
祝好

我想问的是为什么只是出现了部分条带，其他的是什么原因出不来呢？是体系还是其他问题呢？谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2013-03-21 22:59:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

changes

木虫 (正式写手)
你的检测是用的非变性胶吧。对于SSR标记，建议利用变性的PAGE。

看你的条带，应该是体系有问题。
对于有些样品有些引物有产物，有些引物没有产物的问题。你看看你们实验室其它人有没有这个问题，如果不是的话，就排除PCR仪的问题了。另外，每次做PCR减少每批次的数量，每次做13-6个试试。如果以上都排除了，那可能就是的DNA质量的问题了。
赞一下 回复此楼
8楼2013-03-23 21:40:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

forgive09

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-03-23 14:50:05
恕我直言，你的问题就很含糊。一个个体出现多少条带并没有一定的，尤其是SSR这种短串联标记，这就是所谓个体差异。不是说每个个体都会出现预期的条带。如果motif=2，片段差2个碱基在凝胶你基本分析不出来。用SSR标记 ...

真的很感谢你，你讲的有点复杂，我做的是本科的毕业论文！
赞一下 回复此楼
9楼2013-03-24 00:14:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河
要是本科论文，还不如直接磁珠筛选，你去检测多样性，不是来的更简单。
赞一下 回复此楼
将相本无种★男儿当自强
10楼2013-03-25 14:39:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 forgive09 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程302分求调剂 +9 zyx上岸！ 2026-04-04 9/450 2026-04-05 22:08 by 醉翁wl
[考研] 085602调剂 初试总分335 +8 19123253302 2026-04-05 8/400 2026-04-05 20:44 by 南航~万老师
[考研] 318求调剂 +11 ykyhsa 2026-04-05 13/650 2026-04-05 12:44 by aidndnjck
[考研] 求调剂，一志愿郑州大学材料与化工专硕，英二数二342分，求老师收留 +18 v12abo 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 11:37 by a8144223
[考研] 材料调剂 +18 一样YWY 2026-04-02 19/950 2026-04-04 22:14 by hemengdong
[考研] 331求调剂 +3 niby 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:56 by 蓝云思雨
[考研] 342求调剂 +3 Liang7111 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:47 by dongzh2009
[考研] 一志愿0817化学工程与技术，求调剂 +24 我不是只因 2026-04-02 28/1400 2026-04-04 15:15 by dongzh2009
[考研] 325求调剂 +4 春风不借意 2026-04-04 4/200 2026-04-04 14:46 by 湘农储能材料
[考研] 22408，264求调剂 +3 ywh729 2026-04-03 4/200 2026-04-04 11:04 by ywh729
[考研] 317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂 +6 YinTai 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:30 by 无际的草原
[考研] 五邑大学土木工程招调剂生2026 +3 wyutj 2026-03-31 4/200 2026-04-03 18:21 by zengxj_7201
[考研] 274求调剂 +10 薛定谔的虎。 2026-04-01 10/500 2026-04-03 10:13 by tianyyysss
[考研] 专硕 351 086100 也是考的材科基 本科也是材料 +8 202451007219 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:50 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿大工学硕，求调剂 +4 yub0811 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:36 by 百灵童888
[考研] 085602化工求调剂（331分） +9 111@127 2026-03-30 9/450 2026-04-02 20:00 by dick_runner
[考研] 一志愿上海海洋大学083200食品学硕，求调剂，接受其他专业 +6 what张 2026-04-01 7/350 2026-04-02 16:48 by zzsw+
[考研] 08开头看过来！！！ +4 wwwwffffff 2026-03-31 6/300 2026-04-02 11:42 by 均值回归
[硕博家园] 博一被送出联培感觉不适应怎么办 +3 全村的狗 2026-03-31 3/150 2026-04-01 10:44 by 328838485
[考研] 274求调剂 +6 xiao爱同学 2026-03-30 6/300 2026-03-31 10:04 by cal0306
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭