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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
我要学perl么: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-08-16 16:55:05
silicare: 金币+5, BioEPI+1 2013-08-21 17:51:44

引用回帖:

3楼: Originally posted by 我要学perl么 at 2013-08-15 08:42:36
我做的是猪的。
galaxy可以用吗？
如果要自己计算的话是要下载全基因组序列，然后自己写perl代码？

另外有个小问题：就是计算GC含量的时候假如遇到这样的情况，ACGN，GC含量算50%吗？...

I think so
Go to website https://main.g2.bx.psu.edu/
click "get data" in the left panel, choose UCSC main
Select pig in the genome
Search for geecee to calculate gc content

If you are not sure, read the tutorials, particularly this one https://main.g2.bx.psu.edu/u/aun1/p/galaxy101

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回复此楼

4楼2013-08-15 17:33:44

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