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cwtj

木虫 (著名写手)

[求助] 怎样判断两个靶点的同源性

怎样判断两个靶点的同源性
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1楼 2013-07-31 10:54:18
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

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靶点的同源性 就是根据靶点蛋白序列的相似性来进行定义的 相似性越高 同源性越高 可基于序列比对实现
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cwtj
√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
2楼2013-07-31 15:37:59
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cwtj

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ts2009 at 2013-07-31 15:37:59
靶点的同源性 就是根据靶点蛋白序列的相似性来进行定义的 相似性越高 同源性越高 可基于序列比对实现

好像同源性只有是与否的判断，没有多少的量化。判断两个靶点是否是同源，怎样得出结论呢。如果判断相似性，好办，比如相似性多少。但是同源性只有是否的判断。
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3楼2013-07-31 17:23:39
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ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by cwtj at 2013-07-31 17:23:39
好像同源性只有是与否的判断，没有多少的量化。判断两个靶点是否是同源，怎样得出结论呢。如果判断相似性，好办，比如相似性多少。但是同源性只有是否的判断。...

相似性(similarity)和同源性(homology)是两个完全不同的概念。相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨基酸残基顺序所占比例的高低。当相似程度高于50%时，比较容易推测检测序列和目标序列可能是同源序列；而当相似性程度低于20%时，就难以确定或者根本无法确定其是否具有同源性。总之，不能把相似性和同源性混为一谈。所谓“具有50%同源性”，或“这些序列高度同源”等说法，都是不确切的，应该避免使用。  来源于：http://www.dxy.cn/bbs/topic/5163975
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√：寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
4楼2013-07-31 22:06:59
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