应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 关于蛋白序列分析与鉴定的问题，求指教
51/1返回列表
查看: 676  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

applin

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于蛋白序列分析与鉴定的问题，求指教

实验室之前从板蓝根里分离了一个蛋白，进行了N端测序测出了1到10的序列为：QIGEFATAPF，大小为6.87kDa，现在我导师要我利用这10个序列来分析下这是哪种蛋白。我的问题就是我应该从哪些方面入手，需运用哪些工具怎么用，需要参考哪些文献。
  还有就是之前我去NCBI搜了下好像没有合适的，不知是我错了还是什么原因请大神指教啊，如果哪位大神NCBI到了合适了还烦请告诉我正确的辨别方法啊，我对这些东西不太熟。
  这是实验室之前一位师姐留下的数据，老师想让我分析完整，就是从理论上去分析。
  附上我的邮箱82984362@163.com  如果各位有什么相关的资料欢迎轰炸我的邮箱，拜谢

[ Last edited by applin on 2013-7-25 at 00:25 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-07-25 00:23:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

applin

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-07-25 02:08:36
楼主用BLAST是对的, 但是已知序列才10个氨基酸实在太短了. 楼主要想办法知道多一些序列才行.
我不知道板蓝根基因组测序了没, 如果有的话, 或者是板蓝根近亲有被测序, 楼主可以试试tblastn在基因组上找找看有无可能 ...

现在的情况是数据已无法补足，因为这是2年前留下来的东西，所以我只能从这10个序列入手，不知有没相关文献可以参考的，就是有没有前人做过我这样的事，我想看看别人是怎么做的，拜谢
赞一下 回复此楼
4楼2013-07-25 14:50:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-07-25 10:27:57
楼主用BLAST是对的, 但是已知序列才10个氨基酸实在太短了. 楼主要想办法知道多一些序列才行.
我不知道板蓝根基因组测序了没, 如果有的话, 或者是板蓝根近亲有被测序, 楼主可以试试tblastn在基因组上找找看有无可能找到全长.
赞一下 回复此楼
2楼2013-07-25 02:08:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robustli

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-07-25 10:28:13
Since you could not find the possible gene by blast. I think you can first clone this gene out by using a degenerate primer according to this peptide sequence, then you can analyze.
赞一下 回复此楼
immunologyparasite
3楼2013-07-25 03:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 7lpolszZVXgi 2026-08-14 6/300 2026-08-15 09:28 by sunzitan
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 7/350 2026-08-15 09:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +24 医学老男孩 2026-08-13 50/2500 2026-08-15 06:38 by 学员8dgXkO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 HFw0lei2R37i 2026-08-14 8/400 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭