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小分子转化为周期模型
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zlin610
金虫
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[交流]
小分子转化为周期模型
最近在用castep做表面吸附,我想知道计算乙醛,氢气,乙醇等等这些小分子在金表面的吸附时,castep只能计算周期性模型,如何把乙醛,氢气,乙醇等等这些小分子转化为周期性模型来计算呢?
请各位帮帮忙!
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2013-07-22 11:53:10
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wangjl712
木虫
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流,,
2013-07-29 14:06:02
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5楼
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Originally posted by
zlin610
at 2013-07-22 14:41:29
首先谢谢你哈!可以说的再具体点吗,怎么把分子放到盒子里头呢?...
将分子选中,按住shift,并向下按鼠标滚轮,移动鼠标就可以,而且工具里也有移动的图标啊
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14楼
2013-07-28 20:54:12
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lq6865387
木虫
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2013-07-29 14:05:10
CASTEP帮助文件中有实例的 可以去学学 放到晶体上面 就可以吧
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2楼
2013-07-22 12:33:00
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fshadow
木虫
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2013-07-29 14:05:17
自己构建一个立方盒子,然后把你的分子放到盒子的一个顶点处,就可以做分子本身的优化了。一般盒子的尺寸10A就够了,分子太大的话可以加大盒子边长。
我之前是这么做的。。。
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3楼
2013-07-22 14:20:13
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zlin610
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2楼
:
Originally posted by
lq6865387
at 2013-07-22 12:33:00
CASTEP帮助文件中有实例的 可以去学学 放到晶体上面 就可以吧
我要做的是表面吸附,要算吸附分子,金属表面及吸附体系,如何用castep算那些小分子,那些小分子本来不具有周期性呀?你说的castep中的例子,就是CO分子在Pd(110)表面的吸附吗?但是CO分子很小呀,我想算大点的分子,乙醛呀,丁烯醛之类的,怎么得到那些参数呢?
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4楼
2013-07-22 14:39:04
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