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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » ATK 如何建立这几种分子模型啊
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ghostsyd

铜虫 (小有名气)

[交流] ATK 如何建立这几种分子模型啊

我想建立以下几种含有多个苯环的分子模型，该如何操作啊？

我之前试了笨办法，用石墨烯纳米带删减部分原子，然后用左边那个键转为分子。可是加Au电极的时候，发现建的拖不进去，这又是为什么呢? 很急，谢谢大家了！

（PS. 和之前我 发的一个帖子有些类似，因为发错了地方，所以管理员莫怪。。。）
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1楼 2012-07-30 02:41:51
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回帖置顶 ( 共有5个 )

love5264

木虫 (正式写手)
★
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
yutube上有视频教程 看一遍就会了
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3楼2012-07-30 05:44:25
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franch

版主 (著名写手)
★ ★
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
uuv2010: 金币+1, 多谢帮助 2012-08-17 15:39:07
要去掉周期性才能复制的，，
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5楼2012-07-30 12:08:20
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ghostsyd

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by love5264 at 2012-07-30 05:44:25
yutube上有视频教程 看一遍就会了

我只找到了一个苯环的教程，可是没有找到多个的。能否给我个链接啊
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6楼2012-07-30 17:39:03
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ghostsyd

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by franch at 2012-07-30 12:08:20
要去掉周期性才能复制的，，

您好，能否说的稍微具体一些，如何用VNL 直接建立图中的模型啊？
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7楼2012-07-30 17:40:14
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ghostsyd

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by franch at 2012-07-30 12:08:20
要去掉周期性才能复制的，，

而且，貌似苯环是分子，我不清楚有没有周期性。。
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8楼2012-07-30 17:46:58
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飘飘转世

银虫 (小有名气)
★
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
楼主找到了建模的办法没？我也有类似的问题。
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9楼2012-10-24 13:07:59
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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
★
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
楼主如果用08版的话 建议不要用atk建模了 太差了，用ms建模 导入分子坐标就可以了，或者你用新版本2012的 适用两个周，可以导出08的py
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10楼2012-12-04 21:33:43
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531072740

新虫 (初入文坛)
★
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
5楼: Originally posted by franch at 2012-07-30 12:08:20
要去掉周期性才能复制的，，

您知不知道周期性要怎么加上去，谢谢啦
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11楼2015-07-07 10:22:59
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goingabroad2楼
2012-07-30 05:34   回复  
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
xueht987: 金币-1, 非水区，拒绝灌水！ 2012-07-30 20:13:24
dujunhui4楼
2012-07-30 09:40   回复  
ghostsyd(金币+1): 谢谢参与
xueht987: 金币-1, 非水区，拒绝灌水！拒绝纯表情帖，谢谢合作！ 2012-07-30 20:13:32
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