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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】ATK中双电极模型电极与分子之间的距离设置。
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luckyheizi

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ATK中双电极模型电极与分子之间的距离设置。 已有2人参与

各位ATK高手，想问一下双电极模型中（电极/分子/电极），电极与分子之间的距离如何确定？例如，左侧电极为线状金原子，中间是一个晶胞，我想让金原子正对着晶胞边缘处的钕原子，不知金原子与钕原子之间的距离怎么设置？谢谢大家！
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好人有好报。
1楼 2010-09-01 23:28:55
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gaottgougou

金虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-09-03 08:19:23
luckyheizi(金币+1):可不可以比两个原子的半径之和稍大一些就行呢？例如两原子半径之和为3，那我设二者之间的距离为3.5可不可以？谢谢！ 2010-09-03 15:33:26
我建议创建一个金线和分子组成的模型，做一下结构优化（弛豫）。当然金线可以取短一点，取到在弛豫中分子对其影响可以忽略的长度就好
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2楼2010-09-02 21:59:43
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fan159

金虫 (正式写手)
★ ★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流经验 2010-09-03 19:01:16
163.com(金币+1):算总能现在普遍认为ATK的不是很精确，很多都是用vasp算的总能以及结构优化和驰豫……有时间再探讨一下？？ 2010-09-08 08:25:09
luckyheizi(金币+2):请问在双电极模型中，中间部分可以是哪些东西？分子，原子或是块体都可以吗？双电极模型与分子结的关系是什么？ 2010-09-25 16:40:42
目前我的理解是通过总能量来确定距离，你可以用gaussian做一个scan,找到一个大致距离，再在ATK中设置几个不同的距离，找到总能量最小值，然后再进行优化，目前也在试，你可以参考
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3楼2010-09-03 17:53:47
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fan159

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
163.com(金币+1):鼓励新虫子多多发言…… 2010-09-26 22:30:11
理论可以是任何东西，主要是看你研究的意义和性质，如果你放一个东西进去算没有任何意义，算了也没什么用。还有是和实验结合，如果你设计的东西不稳定存在，也不好！
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4楼2010-09-26 18:43:07
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wei.ji

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):谢谢参与！ 2010-09-27 08:35:10
我不用atk哈，不过我建议你看看这个preprint
http://physics.ruc.edu.cn/ji/2010/pubs/bdt-2010.pdf
引用回帖:
Originally posted by luckyheizi at 2010-09-01 23:28:55:
各位ATK高手，想问一下双电极模型中（电极/分子/电极），电极与分子之间的距离如何确定？例如，左侧电极为线状金原子，中间是一个晶胞，我想让金原子正对着晶胞边缘处的钕原子，不知金原子与钕原子之间的距离怎么 ...

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http://sim.phys.ruc.edu.cn
5楼2010-09-26 20:25:41
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