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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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luckyheizi

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ATK中双电极模型电极与分子之间的距离设置。已有2人参与

各位ATK高手,想问一下双电极模型中(电极/分子/电极),电极与分子之间的距离如何确定?例如,左侧电极为线状金原子,中间是一个晶胞,我想让金原子正对着晶胞边缘处的钕原子,不知金原子与钕原子之间的距离怎么设置?谢谢大家!
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好人有好报。
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gaottgougou

金虫 (小有名气)


zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-09-03 08:19:23
luckyheizi(金币+1):可不可以比两个原子的半径之和稍大一些就行呢?例如两原子半径之和为3,那我设二者之间的距离为3.5可不可以?谢谢! 2010-09-03 15:33:26
我建议创建一个金线和分子组成的模型,做一下结构优化(弛豫)。当然金线可以取短一点,取到在弛豫中分子对其影响可以忽略的长度就好
2楼2010-09-02 21:59:43
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fan159

金虫 (正式写手)

★ ★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流经验 2010-09-03 19:01:16
163.com(金币+1):算总能现在普遍认为ATK的不是很精确,很多都是用vasp算的总能以及结构优化和驰豫……有时间再探讨一下?? 2010-09-08 08:25:09
luckyheizi(金币+2):请问在双电极模型中,中间部分可以是哪些东西?分子,原子或是块体都可以吗?双电极模型与分子结的关系是什么? 2010-09-25 16:40:42
目前我的理解是通过总能量来确定距离,你可以用gaussian做一个scan,找到一个大致距离,再在ATK中设置几个不同的距离,找到总能量最小值,然后再进行优化,目前也在试,你可以参考
3楼2010-09-03 17:53:47
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fan159

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
163.com(金币+1):鼓励新虫子多多发言…… 2010-09-26 22:30:11
理论可以是任何东西,主要是看你研究的意义和性质,如果你放一个东西进去算没有任何意义,算了也没什么用。还有是和实验结合,如果你设计的东西不稳定存在,也不好!
4楼2010-09-26 18:43:07
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wei.ji

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):谢谢参与! 2010-09-27 08:35:10
我不用atk哈,不过我建议你看看这个preprint
http://physics.ruc.edu.cn/ji/2010/pubs/bdt-2010.pdf
引用回帖:
Originally posted by luckyheizi at 2010-09-01 23:28:55:
各位ATK高手,想问一下双电极模型中(电极/分子/电极),电极与分子之间的距离如何确定?例如,左侧电极为线状金原子,中间是一个晶胞,我想让金原子正对着晶胞边缘处的钕原子,不知金原子与钕原子之间的距离怎么 ...

http://sim.phys.ruc.edu.cn
5楼2010-09-26 20:25:41
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