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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 小分子转化为周期模型
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zlin610

金虫 (初入文坛)

[交流] 小分子转化为周期模型

最近在用castep做表面吸附，我想知道计算乙醛，氢气，乙醇等等这些小分子在金表面的吸附时，castep只能计算周期性模型，如何把乙醛，氢气，乙醇等等这些小分子转化为周期性模型来计算呢？请各位帮帮忙！
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1楼 2013-07-22 11:53:10
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zlin610

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fshadow at 2013-07-22 14:20:13
自己构建一个立方盒子，然后把你的分子放到盒子的一个顶点处，就可以做分子本身的优化了。一般盒子的尺寸10A就够了，分子太大的话可以加大盒子边长。
我之前是这么做的。。。

首先谢谢你哈！可以说的再具体点吗，怎么把分子放到盒子里头呢?
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5楼2013-07-22 14:41:29
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lq6865387

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-29 14:05:10
CASTEP帮助文件中有实例的  可以去学学   放到晶体上面 就可以吧
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2楼2013-07-22 12:33:00
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fshadow

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-29 14:05:17
自己构建一个立方盒子，然后把你的分子放到盒子的一个顶点处，就可以做分子本身的优化了。一般盒子的尺寸10A就够了，分子太大的话可以加大盒子边长。
我之前是这么做的。。。
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3楼2013-07-22 14:20:13
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zlin610

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lq6865387 at 2013-07-22 12:33:00
CASTEP帮助文件中有实例的  可以去学学   放到晶体上面 就可以吧

我要做的是表面吸附，要算吸附分子，金属表面及吸附体系，如何用castep算那些小分子，那些小分子本来不具有周期性呀？你说的castep中的例子，就是CO分子在Pd（110）表面的吸附吗？但是CO分子很小呀，我想算大点的分子，乙醛呀，丁烯醛之类的，怎么得到那些参数呢？
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4楼2013-07-22 14:39:04
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