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hwchen2000

金虫 (正式写手)

[求助] 单条3-race通用引物扩增出5-6个条带,有没有

各位大侠,最近在做PCR,本来是想做3-race的,没做出来,后来受坛子里的一个虫友启发,只用巢式引物和3-通用引物扩增出6个条带,结果测序结果回来不可思议,上游引物居然就是3-通用引物的互补序列,下游引物就是3-通用引物,后来用3-通用引物做单引物扩增,这6个条带居然全扩出来,真是奇葩了,有没有筒子能解释一下啊
3-通用引物5'-GCTGTCAACGATACGCTACGTAACGGCATGACAGTG (T)18-3'
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hwchen2000

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-07-20 18:43:42
巢式PCR第一轮的时候如果有非特异的引物/模板结合, 这种PCR产物就会在第二轮继续被扩增.
楼主的第一轮巢式PCR温度太低了. 通用引物里面的poly-T和模板末端的poly-A(对应原来mRNA的poly-A)这种结合是你希望发生的,  ...

你说的是有可能的,第一轮PCR是有点模糊,第二轮就清楚了
昨天看了一些帖子,也有这样扩增出来的,但是像我这样扩出6个条带的好像还真没有
我这样再做下去是不是就没有意义了
3楼2013-07-22 10:33:57
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-07-20 21:46:21
巢式PCR第一轮的时候如果有非特异的引物/模板结合, 这种PCR产物就会在第二轮继续被扩增.
楼主的第一轮巢式PCR温度太低了. 通用引物里面的poly-T和模板末端的poly-A(对应原来mRNA的poly-A)这种结合是你希望发生的, 但是如果有某个cDNA中间也有和poly-A相似序列, 你的通用引物也可以勉强集合上, 只要这个发生就会给下面的PCR提供模板.

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-07-20 18:43:42
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