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Leliel

铜虫 (初入文坛)

[求助] Gromacs粗粒化力场(自己写)

各位师兄师姐~
本人准大四学弟一名,正在跟着师兄做粗粒化的模拟,用的是Gromacs 4.6.2。
想要用粗粒化模拟的办法来实现DNA和双层膜的一个共同的体系,现在想的是用两个不同的力场来模拟膜和DNA,但是现在的版本下,这些力场都没有,所以我想自己写一个,但是对自己写力场这个完全不了解(我只是用Gromacs做了两个例子类型的全原子模拟而已),不知道大家能不能给个建议,比如说怎么写力场,有啥模板之类的么?谢谢了!!
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MDs-Gromacs gromacs gromacs 力场

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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果Gromacs里面没有的力场,需要改源代码。很多粗粒化力场,Gromacs已经有了,建议尽量使用已经有的力场。
2楼2013-07-13 10:04:09
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