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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS建无定形晶胞
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呆呆天下

新虫 (小有名气)

[求助] MS建无定形晶胞

做吸附，吸附质没有具体的晶胞参数，是一个无定形结构，有人有做过这方面的实验么，求指教，相关的参考文献或者实例，都好。
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1楼 2013-07-12 16:42:14
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-07-18 16:15:02
被吸附物质是做无定型盒子的依据啊，你要根据下面盒子的大小来建立上面的无定型盒子，要不然叠加layer的时候是无法匹配的
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3楼2013-07-15 17:16:12
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xiongshaohui

铁虫 (正式写手)
同问
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要让世界因为有你而有点不一样！
2楼2013-07-15 16:19:28
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呆呆天下

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-07-15 17:16:12
被吸附物质是做无定型盒子的依据啊，你要根据下面盒子的大小来建立上面的无定型盒子，要不然叠加layer的时候是无法匹配的

有具体的例子么，有点抽象啊，我是新手额，有点难理解
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4楼2013-07-16 09:47:00
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

你说一下你要建什么发给我，我做一个例子给你看看
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5楼2013-07-16 10:56:13
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呆呆天下

新虫 (小有名气)
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5楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-07-16 10:56:13
你说一下你要建什么发给我，我做一个例子给你看看

以甘氨酸为主的一个氨基酸长链，因为不是晶体，所以一直不知道怎么建晶胞
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6楼2013-07-17 09:32:47
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 呆呆天下 at 2013-07-17 09:32:47
以甘氨酸为主的一个氨基酸长链，因为不是晶体，所以一直不知道怎么建晶胞...

这个你建晶胞干什么？做计算啊？
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7楼2013-07-17 09:44:02
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呆呆天下

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-07-17 09:44:02
这个你建晶胞干什么？做计算啊？...

不是，是想做吸附，氨基酸长链上面吸附，后面看能不能验证下结构体系
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8楼2013-07-18 09:23:14
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 呆呆天下 at 2013-07-18 09:23:14
不是，是想做吸附，氨基酸长链上面吸附，后面看能不能验证下结构体系...

我明白你说的意思，我是说做哪方面，要不我咋帮你建模型？
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9楼2013-07-18 10:16:42
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呆呆天下

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by anmin0127 at 2013-07-18 10:16:42
我明白你说的意思，我是说做哪方面，要不我咋帮你建模型？...

思路是这样的，一个带羟基的物质，通过静电作用或者范德华力等等，吸附到氨基酸长链上，我现在都有点怀疑，这个能用MS来计算么
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10楼2013-07-18 15:34:58
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