24小时热门版块排行榜    

查看: 2688  |  回复: 4

fly771125

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助成功】AmorphousCellConst 无定形晶胞构建时出错,求助解决方法,谢谢

构建glucose无定形晶胞,
之前做个5 molecules, 20 monomers of chain length each molecule, 没有问题,

今天做30 monomer,2 molecules都不成功
warning 如下:
AmorphousCellConstruct has finished with no arc file.
This usually indicates that all building attempts resulted in structures containing ring catenations or spearing.
ERROR Please see the acclog file for further details.

我的理解就是Glucose有环状存在,在做amorphous cell 构建时环过多容易产生spearing和catenation

能否有人告诉我解决的办法,非常感谢!

求助成功

[ Last edited by fly771125 on 2010-12-15 at 05:36 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

人往往因为丁点儿的梦想,就有了属于自己的传奇!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly771125

木虫 (正式写手)

没有人碰到这个问题吗?
人往往因为丁点儿的梦想,就有了属于自己的传奇!
2楼2010-12-02 01:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pumf

木虫 (正式写手)


ellsaking(金币+1):谢谢回帖交流~ 2010-12-07 09:42:52
没碰到过,我一直碰到的是没有力场,但是明明在AC的compass力场中有我要建立的原子的力场,且我用discover运算也没有问题,但是就是用AC建模的时候不行。请知道的高手指教,多谢了。
3楼2010-12-07 09:40:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly771125

木虫 (正式写手)

Does anyone help us to figure it out?
人往往因为丁点儿的梦想,就有了属于自己的传奇!
4楼2010-12-08 06:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly771125

木虫 (正式写手)


zzy870720z(金币+1):谢谢总结,如果问题解决,请帮忙吧标题修改为【求助成功】,谢谢合作 2010-12-11 08:36:25
没有太完美的解决方法,写几个仅供参考
1,体系初始密度设小一些
2,使用ramp逼近需要的密度
3,盒子里面填充溶剂来避免环之间太近

cite the answer by qasd

Thank you! I will try these ways to solve my problem.
人往往因为丁点儿的梦想,就有了属于自己的传奇!
5楼2010-12-11 03:01:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fly771125 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 听说今天filecode变了 +20 布布和一二 2026-08-06 40/2000 2026-08-07 09:49 by olivermiaoer
[基金申请] filecode +12 等待解的谜 2026-08-06 16/800 2026-08-07 09:01 by wlwhappy
[基金申请] 基金中了 +9 laoda193707 2026-08-06 9/450 2026-08-07 08:54 by ZJTJZ
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +4 archvillain 2026-08-06 8/400 2026-08-07 08:06 by 带你看大海
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 6/300 2026-08-06 20:19 by 苏知砚
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 12/600 2026-08-06 15:11 by eddyin
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[教师之家] 咨询面上基金 +4 李长云 2026-07-31 7/350 2026-08-06 11:20 by 李长云
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +22 低垂的野花 2026-07-31 30/1500 2026-08-05 18:03 by 低垂的野花
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +3 哈哈114477 2026-08-01 3/150 2026-08-04 15:40 by tegsgjy20
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见