应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » NPT系综下判断是否平衡的标志
51/1返回列表
查看: 3889  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lucaca

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] NPT系综下判断是否平衡的标志

跑了一段NPT，600K，现在温度变化大概是600±40K，这个浮动可以判断体系在这一系综下达到平衡了吗？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

晶体模型计算分析 MDs-Gromacs

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2013-07-05 22:59:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)
★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by wbn at 2013-07-06 10:04:39
关注温度的波动这个意义不大吧..因为分子模拟是小体系，而温度是宏观量，体系的温度是由分子的速度和动量算出来的，所以波动一定很大。所以我觉得判断体系是否平衡主要看能量，密度等等是不是收敛，rmsd是不是一条 ...

前辈，如何得到能量，密度呢 ？如何用gui 提取STATIS能量数据吧？求指点，感激不尽！！
赞一下 回复此楼
8楼2014-06-26 15:19:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

shengxiang

木虫 (著名写手)
★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
判断是否平衡的话可以用能量啊，RMSD之类的信息
赞一下 回复此楼
2楼2013-07-05 23:54:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbn

银虫 (小有名气)
★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
NPT判断是否平衡难道不是看密度的波动么？
赞一下 回复此楼
3楼2013-07-06 03:53:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucaca

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shengxiang at 2013-07-05 23:54:53
判断是否平衡的话可以用能量啊，RMSD之类的信息

那么比如说RMSD，算出来的数值为多少的时候就算是平衡了？
赞一下 回复此楼
4楼2013-07-06 05:09:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭