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NPT系综下判断是否平衡的标志
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lucaca
铁杆木虫
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[交流]
NPT系综下判断是否平衡的标志
跑了一段NPT,600K,现在温度变化大概是600±40K,这个浮动可以判断体系在这一系综下达到平衡了吗?
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1楼
2013-07-05 22:59:42
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wangyulinup
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lucaca(金币+1): 谢谢参与
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6楼
:
Originally posted by
wbn
at 2013-07-06 10:04:39
关注温度的波动这个意义不大吧..因为分子模拟是小体系,而温度是宏观量,体系的温度是由分子的速度和动量算出来的,所以波动一定很大。所以我觉得判断体系是否平衡主要看能量,密度等等是不是收敛,rmsd是不是一条 ...
前辈,如何得到能量,密度呢 ?如何用gui 提取STATIS能量数据吧?求指点,感激不尽!!
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8楼
2014-06-26 15:19:40
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shengxiang
木虫
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★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
判断是否平衡的话可以用能量啊,RMSD之类的信息
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2楼
2013-07-05 23:54:53
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wbn
银虫
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★
lucaca(金币+1): 谢谢参与
NPT判断是否平衡难道不是看密度的波动么?
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3楼
2013-07-06 03:53:40
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lucaca
铁杆木虫
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2楼
:
Originally posted by
shengxiang
at 2013-07-05 23:54:53
判断是否平衡的话可以用能量啊,RMSD之类的信息
那么比如说RMSD,算出来的数值为多少的时候就算是平衡了?
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4楼
2013-07-06 05:09:15
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