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MOE软件中蛋白-配体相互作用能怎么算?
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| 在有个地方看到说先导入蛋白-配体复合物,然后加氢加电荷。接下来选中配体,执行Compute,Potential Energy,之后在窗口最上方会有显示。我试了很多复合物,发现结果都在50-150之间。计算给出的数值的单位是kcal/mol 吧?如果是,就有问题了,因为小分子和蛋白的作用能也就是40kJ/mol左右啊,按照它给出的结果岂不是有好几百kJ/mol了?求用过软件的大神,到底该怎么用?谢谢! |
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