| 查看: 3951 | 回复: 8 | |||
[交流]
如何将sybyl对接后的蛋白质和配体保存成一个PDB文件 已有6人参与
|
|
大家好，我在用sybyl软件中的surflex-dock做完对接后，如何将蛋白质和配体保存成一个PDB文件，想用这个复合体进行pymol的修饰，希望有知道的朋友指点下，非常着急，先谢谢大家了！ 1111111111111 [ Last edited by voov on 2014-11-25 at 11:45 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
26药学专硕105500求调剂
已经有8人回复
-
297，工科调剂?
已经有11人回复
-
申博自荐
已经有4人回复
-
294求调剂
已经有9人回复
-
289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校)
已经有5人回复
-
291求调剂
已经有11人回复
-
304求调剂
已经有8人回复
-
求调剂推荐
已经有9人回复
-
求调剂
已经有12人回复
-
291求调剂
已经有13人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- sybyl做分子对接，画的小分子对接不成功
已经有16人回复
- 对接中 用sybyl画出了配体的结构式 对接时报错
已经有8人回复
- 请教各位大牛，SYBYL-X中，SURFLEX-DOCK可加两个配体吗？可加水箱进行对接吗？
已经有7人回复
- 求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
已经有11人回复
- 请教高人，我的pymol软件导入蛋白后进行cartoon时，出现的怎么是loop结构？
已经有13人回复
- sybyl完成分子对接后，如何将配体和蛋白一起导出为pdb文件？
已经有12人回复
- sybyl中的配体提取和准备问题
已经有7人回复
- 【转帖】用Amber+Gaussian做小分子力场
已经有16人回复
- 【其他】autodock 保存文件
已经有14人回复
- 【求助】SYBYL-分子读入后COMFA不能给出数值时什么原因？
已经有6人回复
2楼2013-05-30 16:43:46
windf1ower
金虫 (正式写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 1023
- 散金: 75
- 红花: 5
- 帖子: 309
- 在线: 130.2小时
- 虫号: 1327872
- 注册: 2011-06-21
- 性别: MM
- 专业: 有机合成
3楼2013-05-30 18:46:54
4楼2013-05-31 10:46:28
5楼2013-05-31 10:46:54
2261970777
金虫 (小有名气)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 533
- 散金: 10
- 红花: 2
- 帖子: 228
- 在线: 108小时
- 虫号: 3355709
- 注册: 2014-08-06
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
6楼2016-02-02 00:35:14
2261970777
金虫 (小有名气)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 533
- 散金: 10
- 红花: 2
- 帖子: 228
- 在线: 108小时
- 虫号: 3355709
- 注册: 2014-08-06
- 性别: GG
- 专业: 合成药物化学
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
是将sybyl对接好的结果直接merge，导出吗？选定配体的时候是将蛋白，和自己的化合物一起选定吗？merge的蛋白是处理好口袋的，还是没处理前的原蛋白？ 发自小木虫Android客户端 |
7楼2016-02-02 01:23:51
8楼2020-12-24 16:33:19
9楼2021-08-10 18:13:09
