| 查看: 1649 | 回复: 1 | |||
[求助]
候选基因序列无变化，但是表达量有差异，这是什么原因引起的？
|
|
（1）我的候选基因有8个，然后我均测了cDNA，没有差异。实在没办法，我就只好做个半定量，然后发现其中有一个基因是有表达量的差异的。（材料1图片是一个基因，我做了两遍，这两张图前面两个是野生型，后面的两个是突变体。）我做了好几遍，都得到这样的结果，其他的候选基因表达量是完全一样的亮度。那我就觉得应该是这个基因，可是我又测了这个基因的启动子，发现启动子也没有差异，但是表达量上又有差异。我就解释不了这个问题了？看了文献说有可能是表观遗传学，那我要怎么进行验证呢？ （2）第二个郁闷的事情是：另外一个材料区间里也有很多候选基因，我也像上一个材料一样也是全部测了cDNA，但是也没有差异，然后做半定量的时候发现有两个基因有表达量的差异，而且这两个基因中间还有8个基因，其他的8个都没有差异，然后我做了3遍，都是这样的结果，（材料2-1和2-2这两个基因：前面两个都是突变体，后面两个是野生型）。当然这两个基因，我的启动子还没有测序，正在做……我不理解的问题是为什么会有两个基因出现这种变化呢？ 这两个材料都是隐性核基因控制的，因为符合3:1的农艺性状。而且是由EMS诱变得到的。 我的问题是： （1）材料1中为什么半定量验证的时候表达量有差异，可是启动子和cDNA都没有差异？ （2）如果材料1可能是表观遗传学，那我可以怎么进行验证？通过专门的测序吗？能不能介绍几篇相关的文献？ （3）材料2中为什么两个基因都出现表达量的变化？ （4）我想问如果是某个候选基因引起的这种性状，那么是不是在表达量上这个基因就肯定有变化？有没有会出现表达量不变化的情况？  材料1.jpg  材料2-1.jpg  材料2-2.jpg |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 表观遗传 |
» 猜你喜欢
面上项目计划书系统状态
已经有18人回复
-
NSFC-UNEP（与联合国环境规划署）合作项目
已经有33人回复
-
植物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有152人回复
-
和伊朗人合作
已经有32人回复
-
江苏省自然基金
已经有8人回复
-
生命科学新英文普刊《INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE》
已经有13人回复
-
国际普刊官网征稿INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE
已经有8人回复
-
200一版的国际普刊（新刊活动），全流程只需七天
已经有2人回复
-
适合大创赛生科赛结项，学分紧急的同学，国际新刊INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE
已经有18人回复
-
INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE 第三期开放投稿，审稿快、版面费低
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 几条序列注释为同一个基因，但这几条序列却拼接不上，相似行也不高
已经有9人回复
- 目的基因的导入
已经有19人回复
- 稀有密码子占多大比例，会影响重组基因的表达？
已经有7人回复
- 如何根据保守序列将基因片段克隆出来
已经有16人回复
- 卡那霉素的基因序列是什么
已经有3人回复
- 关于基因表达量下调的问题
已经有3人回复
- 真核生物基因在大肠中表达 问题
已经有4人回复
- 那些基因可以反映组织内ATP的浓度？
已经有9人回复
- 酶基因表达量高，酶活性就一定高吗？（请大家帮帮忙，谢谢）
已经有12人回复
- 【求助/交流】做真菌异源表达的表达序列是否可从基因组上扩
已经有7人回复
- 【求助/交流】求基因序列差异的分析方法
已经有3人回复
bullfrog325
木虫 (正式写手)
- 应助: 193 (高中生)
- 金币: 2880.3
- 散金: 200
- 红花: 24
- 帖子: 744
- 在线: 269.5小时
- 虫号: 1864929
- 注册: 2012-06-20
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
蝈蝈虫26: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-30 08:43:35
感谢参与，应助指数 +1
蝈蝈虫26: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-30 08:43:35
|
假设你的F2分离实验找对了区域: （1）材料1中为什么半定量验证的时候表达量有差异，可是启动子和cDNA都没有差异？ >>可能启动子找的范围还没有足够大, 你把范围扩大点吧. （2）如果材料1可能是表观遗传学，那我可以怎么进行验证？通过专门的测序吗？能不能介绍几篇相关的文献？ >>我建议先不要验证表观遗传的东西(范围太宽了), 先做一个构建(RNAi, 或者35S, 根据你发现的表达变化来定)转植物, 如果表型是和你怀疑的基因表达量相关, 你应该会从转基因植物上发现类似的表型. 确定了这个再好好研究是什么机理. （3）材料2中为什么两个基因都出现表达量的变化？ >>这个问题不会, 但是我觉得有表型的突变体应该有很多基因表达水平有变化, 或许你的材料2中其中一个基因就是属于这种情况. （4）我想问如果是某个候选基因引起的这种性状，那么是不是在表达量上这个基因就肯定有变化？有没有会出现表达量不变化的情况？ >>不一定, 点突变一般不会影响基因的表达水平. 但是如果表达量不变, 蛋白序列也不变, 多半说明不是这个基因一起表型吧. |
2楼2013-05-29 00:40:01
