24小时热门版块排行榜

返回列表

蝈蝈虫26

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 17
帖子: 4
在线: 1.7小时
虫号: 1349057
注册: 2011-07-18
性别: MM
专业: 植物学研究的新技术、新方

[求助] 候选基因序列无变化，但是表达量有差异，这是什么原因引起的？

（1）我的候选基因有8个，然后我均测了cDNA，没有差异。实在没办法，我就只好做个半定量，然后发现其中有一个基因是有表达量的差异的。（材料1图片是一个基因，我做了两遍，这两张图前面两个是野生型，后面的两个是突变体。）我做了好几遍，都得到这样的结果，其他的候选基因表达量是完全一样的亮度。那我就觉得应该是这个基因，可是我又测了这个基因的启动子，发现启动子也没有差异，但是表达量上又有差异。我就解释不了这个问题了？看了文献说有可能是表观遗传学，那我要怎么进行验证呢？
（2）第二个郁闷的事情是：另外一个材料区间里也有很多候选基因，我也像上一个材料一样也是全部测了cDNA，但是也没有差异，然后做半定量的时候发现有两个基因有表达量的差异，而且这两个基因中间还有8个基因，其他的8个都没有差异，然后我做了3遍，都是这样的结果，（材料2-1和2-2这两个基因：前面两个都是突变体，后面两个是野生型）。当然这两个基因，我的启动子还没有测序，正在做……我不理解的问题是为什么会有两个基因出现这种变化呢？
这两个材料都是隐性核基因控制的，因为符合3:1的农艺性状。而且是由EMS诱变得到的。
我的问题是：
（1）材料1中为什么半定量验证的时候表达量有差异，可是启动子和cDNA都没有差异？
（2）如果材料1可能是表观遗传学，那我可以怎么进行验证？通过专门的测序吗？能不能介绍几篇相关的文献？
（3）材料2中为什么两个基因都出现表达量的变化？
（4）我想问如果是某个候选基因引起的这种性状，那么是不是在表达量上这个基因就肯定有变化？有没有会出现表达量不变化的情况？

材料1.jpg

材料2-1.jpg

材料2-2.jpg

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

表观遗传

» 猜你喜欢

怎么查看固定段11位已经有5人回复
可以准确的通过filecode判断基金中还是不中。已经有15人回复
植物学论文润色/翻译怎么收费? 已经有272人回复
感觉普通人已经没办法玩了，躺平是唯一的出路。已经有26人回复
江苏省优青门槛已经有20人回复
心好累。今年我们部门提交了18个项目。中了11了，可惜我的又挂了已经有10人回复
面上项目计划书已经有7人回复
面上项目计划书附件已经有9人回复
面上项目计划书系统状态已经有18人回复
NSFC-UNEP（与联合国环境规划署）合作项目已经有33人回复
和伊朗人合作已经有32人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

1楼 2013-05-28 09:55:44

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

bullfrog325

木虫 (正式写手)

应助: 193 (高中生)
金币: 2880.3
散金: 200
红花: 24
帖子: 744
在线: 269.5小时
虫号: 1864929
注册: 2012-06-20

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
蝈蝈虫26: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-30 08:43:35

假设你的F2分离实验找对了区域:

（1）材料1中为什么半定量验证的时候表达量有差异，可是启动子和cDNA都没有差异？
>>可能启动子找的范围还没有足够大, 你把范围扩大点吧.

（2）如果材料1可能是表观遗传学，那我可以怎么进行验证？通过专门的测序吗？能不能介绍几篇相关的文献？
>>我建议先不要验证表观遗传的东西(范围太宽了), 先做一个构建(RNAi, 或者35S, 根据你发现的表达变化来定)转植物, 如果表型是和你怀疑的基因表达量相关, 你应该会从转基因植物上发现类似的表型. 确定了这个再好好研究是什么机理.

（3）材料2中为什么两个基因都出现表达量的变化？
>>这个问题不会, 但是我觉得有表型的突变体应该有很多基因表达水平有变化, 或许你的材料2中其中一个基因就是属于这种情况.

（4）我想问如果是某个候选基因引起的这种性状，那么是不是在表达量上这个基因就肯定有变化？有没有会出现表达量不变化的情况？
>>不一定, 点突变一般不会影响基因的表达水平. 但是如果表达量不变, 蛋白序列也不变, 多半说明不是这个基因一起表型吧.

赞一下(3人)

回复此楼

2楼2013-05-29 00:40:01

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主蝈蝈虫26 的主题更新

返回列表