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高通量测序是干什么用的?另外测序后怎样找差异基因
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xinmutian
铁虫
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[交流]
高通量测序是干什么用的?另外测序后怎样找差异基因
如果用转录组高通量测序方法研究控制一种植物性状的基因,测序结束后该怎么做?看着这一堆的结果?怎么来确定是有差异的基因?如何利用测序结果?
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2013-05-23 15:39:45
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WUXUEMEI01
新虫
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7楼
:
Originally posted by
hnndljd
at 2013-05-24 22:51:47
首先要在试验设计上下工夫,设计能够导致这种基因差异表达的对比。举例A处理,得到A和A'的对照。
然后把A和A’的样本分别提取RNA,高通量测序(RNA-Seq),将测序结果做对比。
对比有专门的生物信息学软件。一般会 ...
老师,将测序结果做对比,对比有专门的生物信息学软件,我现在也是在分析测序数据,请问可以用哪些软件做比对啊
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10楼
2014-01-12 13:06:27
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asdry
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2013-05-23 16:08:03
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gzl9901
铁杆木虫
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祝福,祝您前程似锦,同时坚持每天访问论坛领取红包!
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3楼
2013-05-23 16:24:10
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bullfrog325
木虫
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楼主的问题太宽了, 建议先自己看看文献再有选择的重点提问吧. 如:
Methods Mol Biol. 2012;802:259-74. doi: 10.1007/978-1-61779-400-1_17.
How to analyze gene expression using RNA-sequencing data
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6楼
2013-05-23 19:30:28
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xinmutian
4楼
2013-05-23 18:56
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3楼
:
Originally posted by
gzl9901
at 2013-05-23 16:24:10 祝福,祝您前程似锦,同时坚持每天访问论坛领取红包!
xinmutian
5楼
2013-05-23 18:56
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引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
asdry
at 2013-05-23 16:08:03 祝楼主诸事顺利,心想事成!
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