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xinmutian

铁虫 (小有名气)


[交流] 高通量测序是干什么用的?另外测序后怎样找差异基因

如果用转录组高通量测序方法研究控制一种植物性状的基因,测序结束后该怎么做?看着这一堆的结果?怎么来确定是有差异的基因?如何利用测序结果?
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WUXUEMEI01

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by hnndljd at 2013-05-24 22:51:47
首先要在试验设计上下工夫,设计能够导致这种基因差异表达的对比。举例A处理,得到A和A'的对照。
然后把A和A’的样本分别提取RNA,高通量测序(RNA-Seq),将测序结果做对比。
对比有专门的生物信息学软件。一般会 ...

老师,将测序结果做对比,对比有专门的生物信息学软件,我现在也是在分析测序数据,请问可以用哪些软件做比对啊
10楼2014-01-12 13:06:27
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asdry

木虫 (职业作家)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝楼主诸事顺利,心想事成!
2楼2013-05-23 16:08:03
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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝福,祝您前程似锦,同时坚持每天访问论坛领取红包!
3楼2013-05-23 16:24:10
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bullfrog325

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主的问题太宽了, 建议先自己看看文献再有选择的重点提问吧. 如:
Methods Mol Biol. 2012;802:259-74. doi: 10.1007/978-1-61779-400-1_17.
How to analyze gene expression using RNA-sequencing data
6楼2013-05-23 19:30:28
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xinmutian4楼
2013-05-23 18:56   回复  
引用回帖:
3楼: Originally posted by gzl9901 at 2013-05-23 16:24:10 祝福,祝您前程似锦,同时坚持每天访问论坛领取红包!

xinmutian5楼
2013-05-23 18:56   回复  
引用回帖:
2楼: Originally posted by asdry at 2013-05-23 16:08:03 祝楼主诸事顺利,心想事成!

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