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浪~顽石

金虫 (小有名气)


[求助] 结构优化与分子动力学

在MS中,Discover模块中的结构优化与分子动力学之间有什么区别与联系???在进行分子动力学运算之前需要进行结构优化吗??如果需要,为什么????
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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
结构优化的作用是为了避免刚开始模拟时由于坏的初始结构(比如两个原子过于靠近,原子键长过长,键角过小等)造成的超高势能

结构优化不是必须的,但是一般情况下在进行模拟前都应该进行以避免出错,不过以下两种情况不应该使用结构优化
1、初始结构有某种物理意义
2、初始结构本身就是某次模拟的最终结构
3楼2013-05-23 02:03:32
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tylgd2011

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在运行分子动力学之前,为节省机时,进行结构优化,一般不进行优化直接运行动力学计算不了的。一般首先结构优化,应用优化的结构进行动力学计算。
2楼2013-05-21 17:28:03
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