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luocongqiang铁虫 (小有名气)
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[求助]
细菌蛋白酶序列
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| 想问一下大家，不同细菌编码蛋白酶的基因序列是否相同或是差异有多大，是否不同细菌有共同的保守序列。谢谢 |
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【答案】应助回帖
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luocongqiang: 金币+40 2013-05-21 10:35:28
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laozuzunzhe: 金币+3, MicEPI+1, good！ 2013-05-21 15:15:36
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后边那个也叫同原序列吧？！？！ 不同菌种产生的蛋白酶类有很多区别，特别是基因序列很小的变化可以改变蛋白酶的很多性质， 所以从天然的样品中分离和筛选新的菌种和其产生的蛋白酶类这一方面有很多人在研究。 举个例子： CC2菌是经细菌16SRNA基因序列分析证明的一种枯草芽孢杆菌,根据纳豆激酶基因序列设计引和PCR扩增得到与纳豆激酶基因非常相似的基因,GenBankBLAST分析表明CC2菌蛋白酶基因与枯草芽孢杆菌YF038纳豆激酶基因序列仅有2个核苷酸差别,两者均产生编码的氨基酸变化;而与枯草芽孢杆菌DTQ2DR23蛋白酶基因比较有3个核苷酸差别,但是仅有1个编码的氨基酸变化,因此CC2菌的蛋白酶基因编码的蛋白质与DTQ2DR23蛋白酶最相似。GenBankBLAST搜索分析发现与CC2菌蛋白酶基因相似的序列很多,但是其他序列均有2个以上氨基酸的差别。CC2菌蛋白酶基因产生的突变是否影响到蛋白酶性质的变化,需要进一步研究蛋白酶的活性等性质。枯草芽孢杆菌是自然界变异很快的细菌。因此菌体编码的基因序列也在不断的变化,所以从天然样品中分离菌种,克隆相关的基因,获得更多的基因信息非常有意义，自然也就成为业内研究热点。 |
2楼2013-05-20 20:52:11
志子
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