24小时热门版块排行榜    

查看: 1122  |  回复: 3
本帖产生 1 个 MicEPI ,点击这里进行查看

luocongqiang

铁虫 (小有名气)

[求助] 细菌蛋白酶序列

想问一下大家,不同细菌编码蛋白酶的基因序列是否相同或是差异有多大,是否不同细菌有共同的保守序列。谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

志子

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luocongqiang: 金币+40 2013-05-21 10:35:28
laozuzunzhe: 金币+3, MicEPI+1, good! 2013-05-21 15:15:36
后边那个也叫同原序列吧?!?!
不同菌种产生的蛋白酶类有很多区别,特别是基因序列很小的变化可以改变蛋白酶的很多性质,
所以从天然的样品中分离和筛选新的菌种和其产生的蛋白酶类这一方面有很多人在研究。

举个例子:
CC2菌是经细菌16SRNA基因序列分析证明的一种枯草芽孢杆菌,根据纳豆激酶基因序列设计引和PCR扩增得到与纳豆激酶基因非常相似的基因,GenBankBLAST分析表明CC2菌蛋白酶基因与枯草芽孢杆菌YF038纳豆激酶基因序列仅有2个核苷酸差别,两者均产生编码的氨基酸变化;而与枯草芽孢杆菌DTQ2DR23蛋白酶基因比较有3个核苷酸差别,但是仅有1个编码的氨基酸变化,因此CC2菌的蛋白酶基因编码的蛋白质与DTQ2DR23蛋白酶最相似。GenBankBLAST搜索分析发现与CC2菌蛋白酶基因相似的序列很多,但是其他序列均有2个以上氨基酸的差别。CC2菌蛋白酶基因产生的突变是否影响到蛋白酶性质的变化,需要进一步研究蛋白酶的活性等性质。枯草芽孢杆菌是自然界变异很快的细菌。因此菌体编码的基因序列也在不断的变化,所以从天然样品中分离菌种,克隆相关的基因,获得更多的基因信息非常有意义,自然也就成为业内研究热点。
2楼2013-05-20 20:52:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

志子

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

补充后者,把不同种病毒做一个Align,一般会发现以一个区域的同源性很高,这个区域就叫做保守序列。
可变区序列因细菌不同而异,恒定区序列基本保守,所以可利用恒定区序列设计引物,将16S rDNA片段扩增出来,利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
3楼2013-05-20 20:57:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luocongqiang

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 志子 at 2013-05-20 20:52:11
后边那个也叫同原序列吧?!?!
不同菌种产生的蛋白酶类有很多区别,特别是基因序列很小的变化可以改变蛋白酶的很多性质,
所以从天然的样品中分离和筛选新的菌种和其产生的蛋白酶类这一方面有很多人在研究。

...

谢谢 听了你的回答明白好多了
4楼2013-05-21 10:35:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 luocongqiang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +54 医学老男孩 2026-08-13 120/6000 2026-08-19 20:15 by Janus2024
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cHIDTWCTtLlG 2026-08-19 6/300 2026-08-19 18:52 by oCMhZAsgNFoO
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 PnssoZglMj3v 2026-08-19 3/150 2026-08-19 18:04 by oCMhZAsgNFoO
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 PnssoZglMj3v 2026-08-19 4/200 2026-08-19 17:54 by oCMhZAsgNFoO
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
信息提示
请填处理意见