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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 实验研究路线
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C-JingX

金虫 (小有名气)

[求助] 实验研究路线

如果想研究一个未知功能的蛋白，如何预测有哪些残基可能被翻译后修饰？如何预测是否具有激酶、磷酸酶、蛋白酶、糖基转移酶活性？有无可能靶向宿主的某种信号途径？或者修饰某种信号途径？如果修饰，最可能的底物是哪些个？
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【分子生物】EPI帖

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走自己的路，不要追逐别人的脚步！
1楼 2011-12-02 16:08:03
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回帖置顶 ( 共有2个 )

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
C-JingX(金币+5): 哦，好的，谢谢啊，呵呵！ 2011-12-02 19:49:04
wanhscn(金币+2, MolEPI+1): Good！授予专家指数！ 2011-12-06 14:43:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by C-JingX at 2011-12-02 18:25:06:
没有突变体，就是查找了一个基因，NCBI里对其介绍也很少，就是一个未知功能的蛋白，目前有几篇文献中提过，其中一篇说是与细菌细胞壁的完整性有关，但我不知道是不是能用什么方法或软件分析出它的残基是否被修饰 ...

可以直接将序列输到NCBI的protein blast上看一下能否找到相关的蛋白，用Pfam或SMART等分析一下看是否有保守结构域
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jiayoubashaonian
4楼2011-12-02 18:29:10
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking: 回帖置顶 2011-12-02 19:51:01
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-12-02 19:51:06
http://gps.biocuckoo.org/down.php蛋白磷酸化预测软件
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jiayoubashaonian
5楼2011-12-02 18:40:43
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普通回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

楼主有突变体吗？材料很重要。可以根据预测的的保守结构域先大体看一下蛋白的可能的功能。
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jiayoubashaonian
2楼2011-12-02 17:09:31
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C-JingX

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-12-02 17:09:31:
楼主有突变体吗？材料很重要。可以根据预测的的保守结构域先大体看一下蛋白的可能的功能。

没有突变体，就是查找了一个基因，NCBI里对其介绍也很少，就是一个未知功能的蛋白，目前有几篇文献中提过，其中一篇说是与细菌细胞壁的完整性有关，但我不知道是不是能用什么方法或软件分析出它的残基是否被修饰，是否具有磷酸酶或其他酶活性
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走自己的路，不要追逐别人的脚步！
3楼2011-12-02 18:25:06
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