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vasp中做利用NEB或者 Cl-NEB做动力学 需要怎样的计算机配置呢?
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xingyexue
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[交流]
vasp中做利用NEB或者 Cl-NEB做动力学 需要怎样的计算机配置呢?
请问有人用Cl-NEB或者NEB算锂离子传输通道么
我用vasp 第一性原理做的
体系晶胞大概30个原子 做传输晶胞扩到四倍 就是100多个原子了
大概要什么计算机配置能算动呢?
或者有什么集群能算动么?求指点~
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2013-05-20 09:58:17
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enola
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xingyexue(金币+1): 谢谢参与
xingyexue: 金币+4, 谢谢~
2013-05-27 09:41:44
做neb主要是核数要够,假设你有16个images,每个images假设给4个核计算,那样就要64核同时跑
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15楼
2013-05-24 12:35:14
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emilyoyang
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xingyexue(金币+1): 谢谢参与
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2013-05-20 21:07:57
xingyexue: 金币+10, 谢谢 我大概了解了 看来还是要到超算中心算
2013-05-27 09:41:39
100多个原子的体相neb/cl-neb一个节点16核可以算,但相当慢。虽然vasp一般情况下对内存要较低(没castep高)但neb/cl-neb计算要是比较耗内存的。
推荐:32核 64核 128核(可以的话256核更好或者更多核)来跑比较快,可以去国家各大超算中心租用资源进行计算。自己配机器来做这个计算,不太划算,主要是太慢了!
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2楼
2013-05-20 10:07:55
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xingyexue(金币+1): 谢谢参与
做分子动力学很吃内存的
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3楼
2013-05-20 11:31:24
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xyzzz986
木虫
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2013-05-20 21:08:21
NEB是找过渡态吧。没记错的话,VASP会把每个image放到节点上去跑,所以计算cpu的个数和image个数要满足整数比关系。
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4楼
2013-05-20 17:33:48
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