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xingyexue

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] vasp中做利用NEB或者 Cl-NEB做动力学 需要怎样的计算机配置呢？

请问有人用Cl-NEB或者NEB算锂离子传输通道么

我用vasp 第一性原理做的
体系晶胞大概30个原子 做传输晶胞扩到四倍 就是100多个原子了

大概要什么计算机配置能算动呢？

或者有什么集群能算动么？求指点~
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1楼 2013-05-20 09:58:17
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emilyoyang

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流， 2013-05-20 21:07:57
xingyexue: 金币+10, 谢谢 我大概了解了 看来还是要到超算中心算 2013-05-27 09:41:39
100多个原子的体相neb/cl-neb一个节点16核可以算，但相当慢。虽然vasp一般情况下对内存要较低（没castep高）但neb/cl-neb计算要是比较耗内存的。
推荐：32核 64核 128核（可以的话256核更好或者更多核）来跑比较快，可以去国家各大超算中心租用资源进行计算。自己配机器来做这个计算，不太划算，主要是太慢了！
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2楼2013-05-20 10:07:55
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xyzzz986

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流， 2013-05-20 21:08:21
NEB是找过渡态吧。没记错的话，VASP会把每个image放到节点上去跑，所以计算cpu的个数和image个数要满足整数比关系。
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4楼2013-05-20 17:33:48
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普通回帖

171713294

木虫 (正式写手)
★
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
做分子动力学很吃内存的
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3楼2013-05-20 11:31:24
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假大空

木虫之王 (文学泰斗)
★
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
??
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10楼2013-05-20 19:15:54
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asdry

木虫 (职业作家)
★
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
祝楼主诸事顺利，心想事成！
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12楼2013-05-20 19:39:57
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
xingyexue: 金币+4, 谢谢~ 2013-05-27 09:41:44
做neb主要是核数要够，假设你有16个images，每个images假设给4个核计算，那样就要64核同时跑
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15楼2013-05-24 12:35:14
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wlxiao5楼
2013-05-20 18:01   回复  
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
不装蒜6楼
2013-05-20 18:20   回复  
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
luoxiwen7楼
2013-05-20 18:21   回复  
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
wlscj8楼
2013-05-20 18:58   回复  
xingyexue(金币+1): 谢谢参与
祝福
wlscj9楼
2013-05-20 18:58   回复  
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yxg_56811楼
2013-05-20 19:31   回复  
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haixiawu13楼
2013-05-24 02:01   回复  
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失落的豇豆14楼
2013-05-24 08:11   回复  
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