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为啥总是提不出自然界微生物群落的总DNA
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各位大侠,小妹又来问啦~ 小妹我最近做的实验是从载体上收集尽可能多的微生物,提取这些微生物的DNA: 1) 加0.6mL TE悬浮沉淀,并加30µL10%SDS,5µL 20mg/mL蛋白酶K,强烈震荡至均匀,37℃恒温反应0.5~1h。 3) 加1.5mL5mol/LNaCl溶液,混匀。 4) 加1.5mLCTAB/NaCl溶液,混匀,65℃恒温静置20min。 5) 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提两次,轻轻缓慢混匀,8000 r/min, 25℃离心10min,将上清液移至10mL无菌离心管。 6) 加等体积异丙醇,颠倒混匀,室温下静置30min,沉淀DNA。5000r/min离心10min,倒出上层废液,用70%乙醇漂洗后,吸干,溶于适量的TE,-20℃保存,以备后续实验。 第一次我取了0.2g收集的微生物,沉淀时看到有碎碎的白色碎片,跑胶没看到DNA,第二次取了0.4g,沉淀时有白色薄膜,跑胶看到DNA但没有很亮。中间有别的实验就把提的DNA放冰箱了三天,昨天用引物338-518做RCR,25ul体系里加4ul模板,35个循环,跑胶出来只有引物二聚体!而拿我同门提的养殖场沼渣DNA做对照也P了,有短片段的条带,求问这到底是什么问题~ |
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3楼2013-05-15 10:29:18
zhenwuhuang
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