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chenfeng0312铜虫 (初入文坛)
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[求助]
多蛋白质序列的三级结构两两比较
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各位请帮个忙，我的问题如下： 设我有3个蛋白质序列a b c。现在需要得到它们两两之间的三级结构相似度，得：ab ac bc。 当然实际上序列很多，所有如果在网站上这样一对对的输入然后等结果根本不可能。有没有什么软件可以在线上或者本地机上一次性输入（不管输入a b c或是ab ac bc都好了）就可以得到最后结果的？ 我刚找到了一款软件DSSP，可以比较二级结构，满足我的要求，通过构建特征向量确定相似度（细节还没看，但是好像是可行的）。 原来尝试过用blastn做核酸序列两两比较，在本地机上实现了。 现在卡在蛋白质三级结构上了，请各位多多帮忙，谢谢！ |
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