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chenfeng0312

铜虫 (初入文坛)

[求助] 多蛋白质序列的三级结构两两比较

各位请帮个忙,我的问题如下:
设我有3个蛋白质序列a   b    c。现在需要得到它们两两之间的三级结构相似度,得:ab   ac   bc。
当然实际上序列很多,所有如果在网站上这样一对对的输入然后等结果根本不可能。有没有什么软件可以在线上或者本地机上一次性输入(不管输入a b c或是ab ac bc都好了)就可以得到最后结果的?
我刚找到了一款软件DSSP,可以比较二级结构,满足我的要求,通过构建特征向量确定相似度(细节还没看,但是好像是可行的)。
原来尝试过用blastn做核酸序列两两比较,在本地机上实现了。
现在卡在蛋白质三级结构上了,请各位多多帮忙,谢谢!
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