版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
申博辅导
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(4139)
>
虫友互识
(536)
>
文献求助
(475)
>
导师招生
(332)
>
休闲灌水
(147)
>
考博
(132)
>
硕博家园
(122)
>
论文投稿
(107)
>
招聘信息布告栏
(99)
>
博后之家
(86)
>
绿色求助(高悬赏)
(64)
>
考研
(55)
>
SciFinder/Reaxys
(40)
>
基金申请
(40)
>
公派出国
(36)
>
教师之家
(31)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
量子化学
»
量化新手直通车
»
关于搜索过渡态!
9
1/1
返回列表
查看: 1161 | 回复: 8
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
懒羊羊Q
金虫
(小有名气)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 1236.7
散金: 80
帖子: 116
在线: 79.6小时
虫号: 2147710
注册: 2012-11-25
专业: 理论和计算化学
[
求助
]
关于搜索过渡态!
最近在计算小分子过渡态的搜索,一直搜不到。希望大家对参数和结构的调整指点一二!
过渡态没有虚频应该调哪呢?有虚频但是振动方向与原子转移不符,又应该调节哪呢?
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
回复此楼
» 猜你喜欢
推荐给教师的一本单词书《金鱼单词讲义:从26个拉丁字母到106万个英语单词》
已经有32人回复
北京工业大学材料科学与工程学院《院士团队》招收工程专业博士研究生(计算优先)
已经有1人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有286人回复
核磁分析软件MestReNova打开文件时报错
已经有0人回复
在职博后不能申请博后基金了,那么在职博后意义何在?
已经有2人回复
青岛大学化学化工学院分子测量学研究院2026年招收博士研究生
已经有0人回复
香港科技大学(广州)诚招电催化方向博士生(2026秋入学)
已经有0人回复
求助Cu2+1O的CIF文件(PDF: 05-0667)
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐:
(我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
CASTEP过渡态搜索,过渡态能量很高,怎么办?
已经有18人回复
菜鸟提问:关于搜索过渡态的问题
已经有7人回复
CL_NEB方法搜索过渡态 怎么准确获得saddle-point 的几何及相应的振动频率?
已经有5人回复
帮忙说说怎样容易找过渡态?
已经有8人回复
过渡态搜索中反应物相关问题
已经有11人回复
关于dmol3进行过渡态搜索中的energy of barrier
已经有12人回复
[急求]搜索过渡态时,基组选择对频率影响的问题
已经有5人回复
关于使用Dmol3进行过渡态搜索的问题!
已经有18人回复
怀疑不存在过渡态的反应,DMOL3用LST/QST 过渡态搜索,得到的结构和产物一样
已经有10人回复
gaussian搜索过渡态
已经有3人回复
CASTEP过渡态搜索,过渡态能量低于反应物
已经有12人回复
过渡态搜索问题
已经有3人回复
CASTEP搜索过渡态的结果看不懂
已经有7人回复
【求助】用vasp搜寻过渡态的请进
已经有16人回复
【求助】请教CASTEP过渡态搜索和频率计算如何弄?
已经有3人回复
【求助】DMOL3搜索过渡态计算失败——关于虚频
已经有20人回复
【求助】过渡态搜索失败原因??
已经有6人回复
【求助】关于不同多重度的过渡态
已经有7人回复
【求助】DMol3过渡态搜索的相关问题
已经有6人回复
1楼
2013-03-23 21:34:10
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
sxm2012
木虫
(小有名气)
应助: 24
(小学生)
金币: 3052.9
红花: 5
帖子: 248
在线: 496.9小时
虫号: 1765567
注册: 2012-04-19
专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1
2013-03-24 14:28:01
没有虚频可试着调节键长或键角,不符的时候我一般果断舍弃。
赞
一下
回复此楼
2楼
2013-03-24 14:12:49
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
懒羊羊Q
金虫
(小有名气)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 1236.7
散金: 80
帖子: 116
在线: 79.6小时
虫号: 2147710
注册: 2012-11-25
专业: 理论和计算化学
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
sxm2012
at 2013-03-24 14:12:49
没有虚频可试着调节键长或键角,不符的时候我一般果断舍弃。
不符情况下的过渡态肯定是不能要,但我觉得不能把这一路径给否定了呀~调节结构时,是不是主要调节转移的原子的位置?还有就是搜过渡态时有且只有一个虚频,过渡态确认后能量最低点却不能跟产物相对应,是不是要把能量最低点的结构取出来优化、搜过渡态、再确认?我这样做了几次,但是总出现不能对应的情况!急啊、、问题有点多,有点杂,希望耐心解答~谢谢啦!
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞
一下
回复此楼
3楼
2013-03-24 17:34:49
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
sxm2012
木虫
(小有名气)
应助: 24
(小学生)
金币: 3052.9
红花: 5
帖子: 248
在线: 496.9小时
虫号: 1765567
注册: 2012-04-19
专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★
懒羊羊Q: 金币+3,
★
有帮助
2013-03-25 21:28:36
我最近也在尝试找过渡态,你之前的路径可以不舍,就调节你觉得可能的原子之间的键长,或者键角,我就是这样找到的哦。对过渡态做了irc么,看下过渡态的趋势。
赞
一下
回复此楼
4楼
2013-03-24 18:41:49
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
懒羊羊Q
金虫
(小有名气)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 1236.7
散金: 80
帖子: 116
在线: 79.6小时
虫号: 2147710
注册: 2012-11-25
专业: 理论和计算化学
引用回帖:
4楼
:
Originally posted by
sxm2012
at 2013-03-24 18:41:49
我最近也在尝试找过渡态,你之前的路径可以不舍,就调节你觉得可能的原子之间的键长,或者键角,我就是这样找到的哦。对过渡态做了irc么,看下过渡态的趋势。
irc是什么?我用的是DMol。既然没有虚频就不能算过渡态,又怎么看趋势呢?我刚刚接触,什么都不懂,见谅哈~
赞
一下
回复此楼
5楼
2013-03-24 21:00:45
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
sxm2012
木虫
(小有名气)
应助: 24
(小学生)
金币: 3052.9
红花: 5
帖子: 248
在线: 496.9小时
虫号: 1765567
注册: 2012-04-19
专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
你之前不是说已经找到只有一个虚频的了么,下一步可以近一步优化,再做IRC分析,forward,和reverse两个方向。看是不是一个方向朝着反应物,一个方向朝着产物。有这个趋势的话就说明找到的这个就是过渡态。
赞
一下
回复此楼
6楼
2013-03-24 21:19:14
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
sxm2012
木虫
(小有名气)
应助: 24
(小学生)
金币: 3052.9
红花: 5
帖子: 248
在线: 496.9小时
虫号: 1765567
注册: 2012-04-19
专业: 理论和计算化学
我没有用过DMol找过渡态哦,俺也是新手。
赞
一下
回复此楼
7楼
2013-03-24 21:21:36
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
Tracyxi
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 110.8
红花: 1
帖子: 64
在线: 77.3小时
虫号: 2261694
注册: 2013-01-26
专业: 燃烧学
问一下楼主,虚频是什么,在哪里可以看出来?
赞
一下
回复此楼
8楼
2013-03-25 20:50:53
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
懒羊羊Q
金虫
(小有名气)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 1236.7
散金: 80
帖子: 116
在线: 79.6小时
虫号: 2147710
注册: 2012-11-25
专业: 理论和计算化学
引用回帖:
8楼
:
Originally posted by
Tracyxi
at 2013-03-25 20:50:53
问一下楼主,虚频是什么,在哪里可以看出来?
在优化时选上性质frequence,完成后,在tool里找vibrational analysis即可看到。
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞
一下
回复此楼
9楼
2013-03-25 21:27:14
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
第一性原理
量子化学
计算模拟
分子模拟
仿真模拟
程序语言
我要订阅楼主
懒羊羊Q
的主题更新
9
1/1
返回列表
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定