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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 关于搜索过渡态！
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懒羊羊Q

金虫 (小有名气)

[求助] 关于搜索过渡态！

最近在计算小分子过渡态的搜索，一直搜不到。希望大家对参数和结构的调整指点一二！
过渡态没有虚频应该调哪呢？有虚频但是振动方向与原子转移不符，又应该调节哪呢？

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1楼 2013-03-23 21:34:10
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sxm2012

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-03-24 14:28:01
没有虚频可试着调节键长或键角，不符的时候我一般果断舍弃。
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2楼2013-03-24 14:12:49
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懒羊羊Q

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sxm2012 at 2013-03-24 14:12:49
没有虚频可试着调节键长或键角，不符的时候我一般果断舍弃。

不符情况下的过渡态肯定是不能要，但我觉得不能把这一路径给否定了呀~调节结构时，是不是主要调节转移的原子的位置？还有就是搜过渡态时有且只有一个虚频，过渡态确认后能量最低点却不能跟产物相对应，是不是要把能量最低点的结构取出来优化、搜过渡态、再确认？我这样做了几次，但是总出现不能对应的情况！急啊、、问题有点多，有点杂，希望耐心解答~谢谢啦！

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3楼2013-03-24 17:34:49
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sxm2012

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
懒羊羊Q: 金币+3, ★有帮助 2013-03-25 21:28:36
我最近也在尝试找过渡态，你之前的路径可以不舍，就调节你觉得可能的原子之间的键长，或者键角，我就是这样找到的哦。对过渡态做了irc么，看下过渡态的趋势。
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4楼2013-03-24 18:41:49
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懒羊羊Q

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sxm2012 at 2013-03-24 18:41:49
我最近也在尝试找过渡态，你之前的路径可以不舍，就调节你觉得可能的原子之间的键长，或者键角，我就是这样找到的哦。对过渡态做了irc么，看下过渡态的趋势。

irc是什么？我用的是DMol。既然没有虚频就不能算过渡态，又怎么看趋势呢？我刚刚接触，什么都不懂，见谅哈~
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5楼2013-03-24 21:00:45
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sxm2012

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你之前不是说已经找到只有一个虚频的了么，下一步可以近一步优化，再做IRC分析，forward，和reverse两个方向。看是不是一个方向朝着反应物，一个方向朝着产物。有这个趋势的话就说明找到的这个就是过渡态。
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6楼2013-03-24 21:19:14
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sxm2012

木虫 (小有名气)
我没有用过DMol找过渡态哦，俺也是新手。
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7楼2013-03-24 21:21:36
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Tracyxi

铜虫 (小有名气)
问一下楼主，虚频是什么，在哪里可以看出来？
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8楼2013-03-25 20:50:53
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懒羊羊Q

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by Tracyxi at 2013-03-25 20:50:53
问一下楼主，虚频是什么，在哪里可以看出来？

在优化时选上性质frequence，完成后，在tool里找vibrational analysis即可看到。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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9楼2013-03-25 21:27:14
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