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sujialing

木虫 (小有名气)


[交流] gamess 的输出文件

小妹,最近刚刚学习GAMESS,想请教各位大侠有没有关于GAMESS的输出文件和临时文件的相关参考书啊,给推荐一下,还有就是我如果想看我的轨道信息需要CHK文件,怎么办啊?GAMESS怎么查看轨道?
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sujialing

木虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by fmying at 2013-03-18 13:49:46
GAMESS的话可以去它的官网上下啊。下载程序之后(我用的是Linux版)里面有几个文档:

Section 1 - INTRO.DOC - Overview
Section 2 - INPUT.DOC - Input Description
Section 3 - TESTS.DOC - Input Examples
...

谢啦!我也是下Linux下运行GAMES.(*^__^*) 嘻嘻……
5楼2013-03-19 16:31:32
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查看全部 11 个回答

fmying

银虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
sujialing(金币+1): 谢谢参与
zhou2009: 金币+4 2013-03-18 14:33:35
GAMESS的话可以去它的官网上下啊。下载程序之后(我用的是Linux版)里面有几个文档:

Section 1 - INTRO.DOC - Overview
Section 2 - INPUT.DOC - Input Description
Section 3 - TESTS.DOC - Input Examples
Section 4 - REFS.DOC  - Further Information
Section 5 - PROG.DOC  - Programmer's Reference
Section 6 - IRON.DOC  - Hardware Specifics

以上内容是GAMESS的INTRO.DOC中的介绍。这些文件说是.DOC,其实就是文本文档,用记事本,写字板都可以打开。当然,官网上也有PDF版的。

GAMESS中没有CHK文件,忘了高斯的那套吧。比如进行一次计算,输入文件为test.inp (GAMESS输入文件的扩展名为INP),你会得到一个test.dat的文件,里面包含了体系的几何结构,基组,分子轨道($VEC)等。对于几何构型优化,还有每一步的几何构型,还有最终的Hessian矩阵($HESS)。$VEC可以拿出来贴在输入文件中作为初始猜测,$HESS也可以放在输入文件中,为频率计算提供Hessian矩阵。

GAMESS的输出比较有意思。默认是输出到屏幕的。想要得到输出文件,需要重定向一下:
rungms test.inp >&test.out

将输出信息导入到test.out文件中,这个就是你要的输出文件了。看轨道的话可以用MOLDEN软件读取test.out然后查看MO,或者用GAMESS开发组提供的MacMolPlt。这个软件专门为GAMESS设计,可以利用输出文件(如test.out)或者DAT文件(如test.dat)查看结果,包括几何构型,分子轨道,振动频率和模式等等,也可以建模,产生输入文件。和GaussianView的功能非常接近。
最后附上两个网址:
GAMESS官网:   http://www.msg.ameslab.gov/gamess/
MacMolPlt官网: http://www.scl.ameslab.gov/MacMolPlt/
2楼2013-03-18 13:49:46
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CMLY

银虫 (初入文坛)



sujialing(金币+1): 谢谢参与
问下我的 inp 文件用gamess提交怎么提交?在linux系统下, 我输入的命令是
   ./rungms mm.inp  运行错误  我又输入 rungms mm.inp 01 1 > & mm.log &  还是不行  01 是版本,1是CPU  我打开rungms看里面用的就是01版本, 求高人指点??  如何提交运算啊???

1.jpg

8楼2013-03-20 11:21:53
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fmying

银虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
为什么不行?有没有仔细看过?是你编译的GAMESS有问题,还是输入文件的问题?抑或是别的什么问题?
9楼2013-03-20 17:32:21
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简单回复
sujialing6楼
2013-03-19 16:46   回复  
引用回帖:
3楼: Originally posted by littledog123 at 2013-03-18 17:45:02

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