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akikucoco

铜虫 (小有名气)

[求助] GAMESS输入文件求助

$CONTRL SCFTYP=RHF ICHARG=0 MULT=1 COORD=COORD pp=read RELWFN=DK $END
$SYSTEM TIMLIM=2000 MEMORY=900000 $END
$GUESS  GUESS=HUCKEL $END
$DATA
uo2co3 hf
C1
U  92.0         0.0868712118 -0.000000001  0.1633241144
S   4
  1      2.4440000              0.2802780        
  2      1.4330000             -1.3231100        
  3      0.6677000              1.3949990        
  4      0.2556000              0.4531230        
S   5
  1      2.4440000             -0.0837540        
  2      1.4330000              0.6082360        
  3      0.6677000             -0.8184330        
  4      0.2556000             -0.9057530        
  5      0.1200000              1.2340200        
S   1
  1      0.0400000              1.0000000        
P   3
  1      1.1380000             -0.5581500        
  2      0.6874000              0.9701720        
  3      0.2506000              0.5419030        
P   4
  1      1.1380000              0.2257630        
  2      0.6874000             -0.4204690        
  3      0.2506000             -0.5459030        
  4      0.1200000              0.7429360        
P   1
  1      0.0400000              1.0000000        
D   1
  1      0.3826000              1.0000000        
D   1
  1      0.1473000              1.0000000        
F   2
  1      4.1130000              0.2189930        
  2      1.6970000              0.4595390        
F   2
  1      0.6774000              0.4216990        
  2      0.2510000              0.1790660            
  
O        8.0         -0.0035237023 0.0000000043 2.32220602783
N31    6
      
O        8.0          1.9275622146 0.0000000043  1.2951920367  
N31   6

O        8.0          -0.0389334201 -1.7519162294 -0.0731299553   
N31    6
      
O        8.0           -0.038933422 1.7519162309 -0.0731299589
N31   6
     
O        8.0         1.9081335885  0.0000000019 3.5878237461     
N31   6

C        6.0          1.3452871707,-0.0000000112,2.5293774024
N31    6      

$END
$ECP
  U-ECP GEN     78     4
  7      ----- g potential     -----
     -0.2252710        0      4.5162725        
    -53.7805701        1    368.6876952        
   -516.3052053        2    112.7576708        
   -202.6738222        2     30.2032915        
    -62.5644049        2     10.2978355        
    -21.5589559        2      3.4910515        
     -1.5390545        2      1.2668391        
  8      ----- s-g potential     -----
      2.6118816        0    257.3529442        
     81.2356657        1     83.1605428        
    353.2465364        2     29.7200513        
    311.9292234        2      6.2482132        
   -423.5525795        2      4.1634672        
    293.2160836        2      3.0001511        
    -21.3442552        2      1.5600000        
      1.6692548        2      0.8700000        
  8      ----- p-g potential     -----
      1.8414388        0    288.7298250        
     75.7054755        1     76.7838420        
    288.4601674        2     24.8252003        
    250.7289429        2      5.1248735        
   -318.8968061        2      3.7603300        
    160.0844924        2      2.9761706        
     33.7801891        2      1.9919017        
     -2.0699997        2      0.9738832        
  6      ----- d-g potential     -----
      2.9082064        0    350.4699407        
     74.3577628        1    166.7091301        
    587.1140329        2     85.8206119        
    317.2543679        2     26.9842255        
    102.8422117        2      7.1565592        
     22.4214278        2      1.2840855        
  7      ----- f-g potential     -----
      3.9350339        0    251.2670754        
     64.9434120        1    108.0109218        
    265.1804776        2    114.8021895        
    389.4284090        2     39.9112545        
    153.4767221        2     11.9039784        
     12.0807444        2      3.3850772        
     -1.3510138        2      1.2677607        
  $END



以上是输入文件,不知道错在哪里?总是说ILLEGAL BASIS FUNCTION REQUESTED然后计算就结束了。搞了一整天都没办法解决?请高手指点啊,基组来自EMSL网站。
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫

【答案】应助回帖

akikucoco(金币+1): 2011-07-25 17:27:32
"     -1.3510138        2      1.2677607        
  $END
"
应该为
"     -1.3510138        2      1.2677607        
                                   
  $END
"
中间有空格
做中国人的化学!!!!
2楼2011-06-26 09:05:01
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akikucoco

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by akikucoco at 2011-06-25 17:06:45:
$CONTRL SCFTYP=RHF ICHARG=0 MULT=1 COORD=COORD pp=read RELWFN=DK $END
$SYSTEM TIMLIM=2000 MEMORY=900000 $END
$GUESS  GUESS=HUCKEL $END
$DATA
uo2co3 hf
C1
U  92.0         0.0868712118 -0.0000 ...

还是一样的错误
     RUN TITLE
     ---------
uo2co3 hf                                                                       

THE POINT GROUP OF THE MOLECULE IS C1      
THE ORDER OF THE PRINCIPAL AXIS IS     0
*** WARNING! ATOM   1 SHELL    1 TYPE S HAS NORMALIZATION   1.01111949
*** WARNING! ATOM   1 SHELL    2 TYPE S HAS NORMALIZATION   0.90974563
*** WARNING! ATOM   1 SHELL    3 TYPE S HAS NORMALIZATION   2.56780136
*** WARNING! ATOM   1 SHELL    9 TYPE P HAS NORMALIZATION   1.64704378
*** WARNING! ATOM   1 SHELL   10 TYPE P HAS NORMALIZATION   2.23302114
*** WARNING! ATOM   1 SHELL   16 TYPE D HAS NORMALIZATION   1.01751835
*** WARNING! ATOM   1 SHELL   17 TYPE D HAS NORMALIZATION   3.43113266
*** WARNING! ATOM   1 SHELL   22 TYPE F HAS NORMALIZATION   1.33516306
*** ERROR, ILLEGAL BASIS FUNCTION TYPE=O        NGAUSS=   8
ERROR OCCURED READING ATOM NO.   2, INPUT ATOM NO.    2, NAME=O         
CHARGE=  8.0 X,Y,Z=    -0.00352370     0.00000000     2.32220603
    LUCY: DO NOT WORRY, CHARLIE BROWN, WE LEARN MORE
          FROM LOSING THAN WE DO FROM WINNING.
CHARLIE: THEN THAT MAKES ME THE SMARTEST PERSON IN
          THE WORLD!

          ILLEGAL          BASIS FUNCTION REQUESTED.
EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Tue Jun 28 16:02:55 2011
                580000  WORDS OF DYNAMIC MEMORY USED
CPU     0: STEP CPU TIME=     0.00 TOTAL CPU TIME=        0.0 (    0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=        0.3 SECONDS, CPU UTILIZATION IS   0.00%
DDI Process 0: error code 911
ddikick.x: application process 0 quit unexpectedly.
ddikick.x: Fatal error detected.
The error is most likely to be in the application, so check for
input errors, disk space, memory needs, application bugs, etc.
ddikick.x will now clean up all processes, and exit...
ddikick.x: Sending kill signal to DDI processes.
DDI Process 1: terminated upon request.
DDI Process 3: terminated upon request.
DDI Process 5: terminated upon request.
DDI Process 6: terminated upon request.
DDI Process 7: terminated upon request.
DDI Process 2: terminated upon request.
DDI Process 4: terminated upon request.
ddikick.x: Execution terminated due to error(s).
unset echo
Tue Jun 28 16:02:57 CST 2011
0.073u 0.027s 0:02.44 3.6%      0+0k 0+0io 0pf+0w

是不是基组的写法有问题呢?对不同原子采用不同的基组可以这么写吗
3楼2011-06-28 16:04:53
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akikucoco

铜虫 (小有名气)

INTEGRAL INPUT OPTIONS
          ----------------------
NOPK  =       1 NORDER=       0 SCHWRZ=       T

     ------------------------------------------
     THE POINT GROUP IS C1 , NAXIS= 0, ORDER= 1
     ------------------------------------------

     DIMENSIONS OF THE SYMMETRY SUBSPACES ARE
A   =  159

..... DONE SETTING UP THE RUN .....
CPU     0: STEP CPU TIME=     0.00 TOTAL CPU TIME=        0.0 (    0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=        0.6 SECONDS, CPU UTILIZATION IS   0.00%

          ********************
          1 ELECTRON INTEGRALS
          ********************
...... END OF ONE-ELECTRON INTEGRALS ......
CPU     0: STEP CPU TIME=     0.00 TOTAL CPU TIME=        0.0 (    0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=        1.8 SECONDS, CPU UTILIZATION IS   0.00%

          -------------
          GUESS OPTIONS
          -------------
          GUESS =HUCKEL            NORB  =       0          NORDER=       0
          MIX   =       F          PRTMO =       F          PUNMO =       F
          TOLZ  = 1.0E-08          TOLE  = 1.0E-05
          SYMDEN=       F          PURIFY=       F

INITIAL GUESS ORBITALS GENERATED BY HUCKEL   ROUTINE.
    LUCY: DO NOT WORRY, CHARLIE BROWN, WE LEARN MORE
          FROM LOSING THAN WE DO FROM WINNING.
CHARLIE: THEN THAT MAKES ME THE SMARTEST PERSON IN
          THE WORLD!

          ILLEGAL GENERAL  BASIS FUNCTION REQUESTED.
EXECUTION OF GAMESS TERMINATED -ABNORMALLY- AT Tue Jun 28 16:22:19 2011
                580000  WORDS OF DYNAMIC MEMORY USED
CPU     0: STEP CPU TIME=     0.00 TOTAL CPU TIME=        0.0 (    0.0 MIN)
TOTAL WALL CLOCK TIME=        1.8 SECONDS, CPU UTILIZATION IS   0.00%
DDI Process 0: error code 911
ddikick.x: application process 0 quit unexpectedly.
ddikick.x: Fatal error detected.
The error is most likely to be in the application, so check for
input errors, disk space, memory needs, application bugs, etc.
ddikick.x will now clean up all processes, and exit...
ddikick.x: Sending kill signal to DDI processes.
DDI Process 2: terminated upon request.
DDI Process 3: terminated upon request.
DDI Process 5: terminated upon request.
DDI Process 1: terminated upon request.
DDI Process 4: terminated upon request.
DDI Process 7: terminated upon request.
DDI Process 6: terminated upon request.
ddikick.x: Execution terminated due to error(s).
unset echo
Tue Jun 28 16:22:21 CST 2011
0.065u 0.035s 0:03.96 2.2%      0+0k 0+0io 0pf+0w
4楼2011-06-28 16:23:58
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

出错信息已经给出了原因:Huckel不支持U元素

加上选项:

$GUESS  GUESS=HCORE $END
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2011-06-30 00:08:32
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akikucoco

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by beefly at 2011-06-30 00:08:32:
出错信息已经给出了原因:Huckel不支持U元素

加上选项:

$GUESS  GUESS=HCORE $END

谢谢您,我添加完选项之后,还是出现一样的错误。会不会我赝势不对?关键字出错?还得麻烦你帮我看看,因为我是初次接触GAMESS,很多东西都不大懂
6楼2011-06-30 11:48:35
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖


akikucoco(金币+4): 2011-07-25 17:27:52
1. $ECP部分必须包含所有的原子,而且顺序和坐标部分相同。例子见最新版本使用手册的31页

2. pp与RELWFN属于不同的相对论方法,不能混用。或许有个别程序可以把全电子相对论和ECP部分分别进行处理,但是如果未在说明书里写明,绝对不要合用。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
7楼2011-06-30 13:12:08
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akikucoco

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by beefly at 2011-06-30 13:12:08:
1. $ECP部分必须包含所有的原子,而且顺序和坐标部分相同。例子见最新版本使用手册的31页

2. pp与RELWFN属于不同的相对论方法,不能混用。或许有个别程序可以把全电子相对论和ECP部分分别进行处理,但是如果未 ...

恩,按照手册部分,把ECP部分所有原子按顺序弄了。还是一样的错误,难道软件出错了。实在不好意思,再一次出现问题。再一次谢谢您。
8楼2011-06-30 15:46:16
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

加上以上所有修改,并且删除COORD=COORD这个选项(新版本不认),用最新版本的gamess可以计算。只是SCF不收敛。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
9楼2011-06-30 21:55:31
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