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cuicchao

金虫 (正式写手)


[交流] 奇怪的连接反应

大家好!近来在做目的基因和质粒的连接,在转化时出现了一个奇怪的现象,请教大家分析下。我回收的目的基因和载体都还是比较纯的(用的是OMEGA试剂盒提取的)。我用TAKARA的solution1,16摄氏度,45min连接,之后直接转化DH5阿尔法,我做了全菌的PCR,再提取质粒PCR结果都有正确的结果,但是我跑质粒和双酶切的核算电泳胶都没有条带。这是问什么呢?!!!
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
15楼: Originally posted by 逆天打酱油 at 2013-03-09 12:26:59
全菌PCR有可能是连接转化过程中连接使用的片段有沾到菌体上造成污染

至于卤煮说提取质粒后PCR也有片段,这个看来可以排除上面的情况,但是会怀疑有可能是PCR使用的试剂有污染,建议卤煮设置负对照,譬如空载为模 ...

恩,这样不错,我下次做的时候设几个对照,谢谢了!另外我说的没条带意思是什么也没有。
16楼2013-03-09 20:22:57
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无为书生

铁虫 (小有名气)



cuicchao(金币+2): 谢谢参与
全菌PCR和质粒PCR很可能是你的PCR体系污染了,建议做阴性对照,16度连45min是不是有点短,不要太相信连接酶的说明书了。
2楼2013-03-08 10:48:15
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by 无为书生 at 2013-03-08 10:48:15
全菌PCR和质粒PCR很可能是你的PCR体系污染了,建议做阴性对照,16度连45min是不是有点短,不要太相信连接酶的说明书了。

不加目的基因和质粒做个阴性对照吗?
3楼2013-03-08 10:53:31
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无为书生

铁虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by cuicchao at 2013-03-08 10:53:31
不加目的基因和质粒做个阴性对照吗?...

不是,其实是每次做PCR时都应该做阴性对照的,就是PCR体系一样,但是模板用超纯水代替,PCR条件之类的也要完全一致。
4楼2013-03-08 10:58:53
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