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wangdandelia

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】聚乙二醇在连接反应中的作用 已有4人参与

大家有没有在平末端连接反应体系中加入过聚乙二醇8000呢?
效果好不好啊?
应该加入多少聚乙二醇呢?
对后续的转化有没有影响?
我的是T4DNA连接酶,连接质粒载体和小DNA片段。
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wangdandelia

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-12-30 17:45:15:



平端连接对底物浓度及酶的浓度要求比较高,可以用NEB或者Promega的连接酶,TaKaRa的T4就算了。

恩,我是用的NEB的T4连接酶。
能说具体一点吗?到底酶和DNA需要多高浓度呢?谢谢了!

[ Last edited by wangdandelia on 2010-12-30 at 17:57 ]
5楼2010-12-30 17:55:47
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
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reasonspare(金币+1):谢谢分享 2010-12-30 17:51:45
连接酶我现在都用那种预混好的mix
就是酶和buffer预混在一起的,直接加入到质粒和片段的混合液就好了~

没试过聚乙二醇
2楼2010-12-30 17:17:03
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wangdandelia

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-12-30 17:17:03:
连接酶我现在都用那种预混好的mix
就是酶和buffer预混在一起的,直接加入到质粒和片段的混合液就好了~

没试过聚乙二醇

请问你用的是哪个公司的mix啊?连接平末端效率怎样?
3楼2010-12-30 17:42:20
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

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★ ★
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reasonspare(金币+1):谢谢分享 2010-12-30 17:52:02
引用回帖:
Originally posted by wangdandelia at 2010-12-30 17:42:20:

请问你用的是哪个公司的mix啊?连接平末端效率怎样?

平端连接对底物浓度及酶的浓度要求比较高,可以用NEB或者Promega的连接酶,TaKaRa的T4就算了。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-12-30 17:45:15
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kun2199

金虫 (小有名气)


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好像主要是增加连接体系内的拥挤程度,增加载体和片段的碰撞几率,用过两次,没起到效果,Takala的T4连接酶可以连接平端,我连过3k片段加8k的载体,不加水,10ul小体系,片段亮度要大。
6楼2010-12-30 18:08:25
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brightfuture01

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引用回帖:
Originally posted by wangdandelia at 2010-12-30 17:55:47:

恩,我是用的NEB的T4连接酶。
能说具体一点吗?到底酶和DNA需要多高浓度呢?谢谢了!

[ Last edited by wangdandelia on 2010-12-30 at 17:57 ]

10ul的体系,加1uL的酶,除过buffer,剩下的都加载体和DNA。

小片段的连接要时间长。当初我们实验室一个老师做启动子连接,连了好几次没成功,后来又做了一次,结果这次碰上了搬家。一周过后想起来了,抱着试试看的心态转了一次,结果长了好多。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
7楼2010-12-30 19:49:05
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wangdandelia

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-12-30 19:49:05:



10ul的体系,加1uL的酶,除过buffer,剩下的都加载体和DNA。

小片段的连接要时间长。当初我们实验室一个老师做启动子连接,连了好几次没成功,后来又做了一次,结果这次碰上了搬家。一周过后想起来了,抱 ...

哦,好的,谢谢哦~
呵呵,那你们的连接条件是多少度呢?连接多长时间?还有载体与短片段DNA的比例是大约多少?
莫怪我问题多呀,O(∩_∩)O~
8楼2010-12-30 20:38:05
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

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引用回帖:
Originally posted by wangdandelia at 2010-12-30 20:38:05:

哦,好的,谢谢哦~
呵呵,那你们的连接条件是多少度呢?连接多长时间?还有载体与短片段DNA的比例是大约多少?
莫怪我问题多呀,O(∩_∩)O~

如果你想过夜连的话可以在16度,如果想更久的话就放在4度。我们一般就在16度过夜,做不出来才考虑长时间4度连接。

外源DNA与载体DNA的摩尔比为10:1,记得是摩尔比哈,不是质量比。这个比例还可以加大。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
9楼2010-12-30 20:40:48
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

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不要误导到别人了,是说很小的片段平端连接的时候可以这样的比例。一般情况3:1就可以了。
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10楼2010-12-30 20:43:00
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