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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 小分子配体结构多活性影响问题
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高興丶

铁虫 (初入文坛)

[求助] 小分子配体结构多活性影响问题

上面横排两个分子是老师画的 下面横排分子是我画的 我是严格按照文献中小分子画的 老师画的却把下面的-SO3Na基团没画上 我想问下 这影不影响我做Comfa的数据效果啊？请大神帮我分析分析呗。。

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1楼 2013-03-01 11:28:40
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126406380

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-03 09:29:30
我观察你的那个结构，发现共同结构应该在两个环的连接处，所以应该没有多大关系
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成功是一种标志
3楼2013-03-01 14:36:14
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126406380

金虫 (著名写手)
★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-03 09:29:25
这个就看你的配体分子跟蛋白质对接的时候是哪一部分，如果是活性部分，那么你的老师画的就欠妥，如果不是活性部分，无所谓。不过我个人觉得还是用你自己的，因为可能在你做comfa之前需要做优化，当然结构不同，优化的结果就有差别。
赞一下(1人) 回复此楼
成功是一种标志
2楼2013-03-01 14:34:18
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