应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 《求助》 转录组样品，混合与分开测序的区别？！！！
51/1返回列表
查看: 5945  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

kopbin

铁虫 (小有名气)

[求助] 《求助》 转录组样品，混合与分开测序的区别？！！！ 已有1人参与

本人想设计一个转录组测序的对比实验，现在考虑到样品问题。
公司给的方案里实验组和对照组各6个样品，而且是分别测序，3*6=18个测序反应，我一看费用挺高，而且我们的样品本身代价就很高。。看到有好多文章都是将一组样品进行混合，然后测序。
1.我就想问下分开单个测序与混合之后测序的结果区别在哪里，有多大的区别？
2.我想到的是每个组采集3个样品，混合后测序。这样能不能有说服力？

O(∩_∩)O谢谢。。。。非常感谢。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

基因芯片VS基因测序

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
每天进步一点点
1楼 2013-01-24 11:04:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kopbin

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 海骄子 at 2013-01-24 11:39:57
混合样是包含多个样品中全部表达的Unigene，不能从中有效的找出每个样品的上调和下调基因！不知你的研究对象是不是有基因组可供参考，若是有的话，可做数字表达谱，相对价格便宜些！若没有，建议转录组和表达谱结合 ...

猪的，我分析两个品种的差异表达，寻找某个性状的分子机制以及通路等信息。。。。我想的是，如果这个性状的机制是一定的，那么转录组中对应该性状的表达也应该是一定的，我选择的3个，相当于生物学重复。。。我想应该是够了的。
赞一下 回复此楼
每天进步一点点
3楼2013-01-24 12:04:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

海骄子

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kopbin: 金币+3, ★有帮助 2013-01-25 21:40:00
混合样是包含多个样品中全部表达的Unigene，不能从中有效的找出每个样品的上调和下调基因！不知你的研究对象是不是有基因组可供参考，若是有的话，可做数字表达谱，相对价格便宜些！若没有，建议转录组和表达谱结合方式进行测序研究！！
赞一下 回复此楼
2楼2013-01-24 11:39:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

海骄子

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

三个重复是足够的，这是好像是高水平文章所要要求的。
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-24 13:47:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kopbin

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 海骄子 at 2013-01-24 13:47:20
三个重复是足够的，这是好像是高水平文章所要要求的。

嗯，我就想知道混合着测序和单个测序的区别了。
赞一下 回复此楼
每天进步一点点
5楼2013-01-24 16:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭