24小时热门版块排行榜    

查看: 2120  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

finesand

铜虫 (小有名气)

[求助] NCBI BLAST的应用

Basic BLAST 部分有个Entrez Query 可以对比对结果进行适当的限制,具体如何限制,在什么情况下要限制,大家可以解释下吗,我刚刚接触这部分知识,但是时间比较紧,不是很懂帮助上的解释和例子,请大家帮帮忙!O(∩_∩)O谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finesand

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by robertorun at 2013-01-23 09:35:27
好比你只搜索某个物种的,就可以限制organism

organism应该输入拉丁属名吗?这样的话是不是只与该属的已知DNA序列比对,如果不输入的话,是不是也会优先对比该属呢?
6楼2013-01-23 10:15:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

梦玲生物医学

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你把你要做的具体例子拿出来,没有具体实际例子不好讲。
2楼2013-01-23 03:28:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robertorun

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
finesand: 金币+1, 有帮助, O(∩_∩)O谢谢 2013-02-15 23:34:58
好比你只搜索某个物种的,就可以限制organism
3楼2013-01-23 09:35:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finesand

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 梦玲生物医学 at 2013-01-23 03:28:31
你把你要做的具体例子拿出来,没有具体实际例子不好讲。

是这样的,我想比对的是鸟类的DNA序列,当Choose Search Set的Database选择others后下面的选项应该怎样设置呢?顺便问下上面的Align two or more sequences 是干什么用的,我现在是有很多个样品的DNA序列(cytb那个区域,全测序,其中起始端出现不规则套峰),要建树的话,是一个一个地比对,找出每个序列的相似序列,然后综合这些相似的序列来建树吗?不好意思啦!本人菜鸟一个,问的问题可能不专业,多多见谅,先谢了!
4楼2013-01-23 09:48:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 7/350 2026-09-01 15:18 by myrtle
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见