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NCBI BLAST的应用
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finesand
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NCBI BLAST的应用
Basic BLAST 部分有个Entrez Query 可以对比对结果进行适当的限制,具体如何限制,在什么情况下要限制,大家可以解释下吗,我刚刚接触这部分知识,但是时间比较紧,不是很懂帮助上的解释和例子,请大家帮帮忙!O(∩_∩)O谢谢!
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1楼
2013-01-22 14:25:46
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robertorun
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finesand: 金币+1,
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有帮助, O(∩_∩)O谢谢
2013-02-15 23:34:58
好比你只搜索某个物种的,就可以限制organism
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3楼
2013-01-23 09:35:27
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梦玲生物医学
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【答案】应助回帖
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你把你要做的具体例子拿出来,没有具体实际例子不好讲。
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2楼
2013-01-23 03:28:31
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2楼
:
Originally posted by
梦玲生物医学
at 2013-01-23 03:28:31
你把你要做的具体例子拿出来,没有具体实际例子不好讲。
是这样的,我想比对的是鸟类的DNA序列,当Choose Search Set的Database选择others后下面的选项应该怎样设置呢?顺便问下上面的Align two or more sequences 是干什么用的,我现在是有很多个样品的DNA序列(cytb那个区域,全测序,其中起始端出现不规则套峰),要建树的话,是一个一个地比对,找出每个序列的相似序列,然后综合这些相似的序列来建树吗?不好意思啦!本人菜鸟一个,问的问题可能不专业,多多见谅,先谢了!
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4楼
2013-01-23 09:48:10
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额,我的最终目的是想区分每个样品是那种鸟类
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5楼
2013-01-23 10:10:26
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