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yolanda1234

金虫 (小有名气)

[求助] 简单建模问题,急求

本人建立在镨(001)面上吸附碳原子,但是碳原子加进去以后,没有形成跟镨形成键,而且镨的结构是由ms导入的,发现原子间没有键相连,但是由ms中直接导入的氧化镧原子之间有键,请问那个键怎么加上去,还有我那个碳原子跟镨之间的没有键是否也能算吸附?
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新手上路,小木虫,我的科研伴侣
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yolanda1234

金虫 (小有名气)

还想请问楼上两位哦,bond里面需要选择include all elements吗?我试了一下发现,有点会全部生成键,有的只有表面那一层的键显示。。。还有,石墨上添加原子,结果bond——calculate以后,石墨的芳香键变成了单键跟双键混合了,怎么改回来呢?
新手上路,小木虫,我的科研伴侣
4楼2013-01-10 11:18:12
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查看全部 9 个回答

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yolanda1234: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 看到你的回复,我试了一下,真的有键生成呢! 2013-01-10 11:11:45
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-12 13:19:19
在MS的bulid->bond 点击一下calculate bond 就可以显示成键了
至于吸附上没有(物理吸附,还是化学吸附)你看成键你看不出来的
需要计算能量差   (如果你看到C与Pr成键了 那这个可能是是化学吸附了)  还有一种可能是放置C原子的时候离Pr原子太远了 这样也不会成键的
2楼2013-01-09 22:08:12
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lion_tiger

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yolanda1234: 金币+6, ★★★很有帮助, 谢谢你,好的,我还在建模的基础上呢。。嗯嗯,等结构优化以后再进行计算! 2013-01-10 11:12:54
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-12 13:19:25
bond 点击一下calculate bond,这个成键的标准是距离,
具体判断成键应该计算电荷密度和电荷密度差分图,从电子分布及得失电子来判断。
3楼2013-01-10 10:27:31
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mika

金虫 (正式写手)

纳米宝贝

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-12 13:19:31
成不成键不是靠软件来看的,因为软件里面可以设定原子成键的距离,具体的要看吸附能和电荷密度图啊
5楼2013-01-10 13:49:01
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