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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 简单建模问题，急求
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yolanda1234

金虫 (小有名气)

[求助] 简单建模问题，急求

本人建立在镨（001）面上吸附碳原子，但是碳原子加进去以后，没有形成跟镨形成键，而且镨的结构是由ms导入的，发现原子间没有键相连，但是由ms中直接导入的氧化镧原子之间有键，请问那个键怎么加上去，还有我那个碳原子跟镨之间的没有键是否也能算吸附？
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新手上路，小木虫，我的科研伴侣
1楼 2013-01-09 18:38:19
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lion_tiger

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yolanda1234: 金币+6, ★★★很有帮助, 谢谢你，好的，我还在建模的基础上呢。。嗯嗯，等结构优化以后再进行计算！ 2013-01-10 11:12:54
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-12 13:19:25
bond 点击一下calculate bond，这个成键的标准是距离，
具体判断成键应该计算电荷密度和电荷密度差分图，从电子分布及得失电子来判断。
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3楼2013-01-10 10:27:31
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yolanda1234: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 看到你的回复，我试了一下，真的有键生成呢！ 2013-01-10 11:11:45
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-12 13:19:19
在MS的bulid->bond 点击一下calculate bond 就可以显示成键了
至于吸附上没有（物理吸附，还是化学吸附）你看成键你看不出来的
需要计算能量差   （如果你看到C与Pr成键了 那这个可能是是化学吸附了）  还有一种可能是放置C原子的时候离Pr原子太远了 这样也不会成键的
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2楼2013-01-09 22:08:12
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yolanda1234

金虫 (小有名气)
还想请问楼上两位哦，bond里面需要选择include all elements吗？我试了一下发现，有点会全部生成键，有的只有表面那一层的键显示。。。还有，石墨上添加原子，结果bond——calculate以后，石墨的芳香键变成了单键跟双键混合了，怎么改回来呢？
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新手上路，小木虫，我的科研伴侣
4楼2013-01-10 11:18:12
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mika

金虫 (正式写手)

纳米宝贝

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-12 13:19:31
成不成键不是靠软件来看的，因为软件里面可以设定原子成键的距离，具体的要看吸附能和电荷密度图啊
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5楼2013-01-10 13:49:01
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