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563078032

木虫 (正式写手)

[求助] 一个B类错误

各位大侠，小弟现在有一个B类错误，不懂怎么消除，请赐教。谢谢大家。
Alert level B
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    O     Ueq(max)/Ueq(min) ...        4.2 Ratio
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1楼 2012-12-25 16:58:23
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖应助，欢迎常来晶体版 2012-12-26 08:47:52
在ins文件里面加delu 0.001 0.002 0.008  O
然后xl
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淡泊名利，宁静致远。
2楼2012-12-25 17:09:27
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08113113

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖应助，欢迎常来晶体版 2012-12-26 08:47:58
也可以试试SIMU 0.01 0.02 3.8 $O
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3楼2012-12-25 17:55:47
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563078032

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 08113113 at 2012-12-25 17:55:47
也可以试试SIMU 0.01 0.02 3.8 $O

用您的方法
Alert level B
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    O     Ueq(max)/Ueq(min) ...        4.2 Ratio
解决了，但又产生了下面错误
Alert level A
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X       H3A    ..  H17B    ..       1.69 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O22    -   H22B   ...          ?
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4楼2012-12-25 18:35:26
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563078032

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lijianghua2007 at 2012-12-25 17:09:27
在ins文件里面加delu 0.001 0.002 0.008  O
然后xl

您好，谢谢您。加这个命令，xl运行不下去。精修也不行。
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5楼2012-12-25 18:44:06
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08113113

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 563078032 at 2012-12-25 18:35:26
用您的方法
Alert level B
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent    O     Ueq(max)/Ueq(min) ...        4.2 Ratio
解决了，但又产生了下面错误
Alert level A
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X      ...

重新加下那几个氢试一试吧，具体我也说不好啊，我也是新手啊嘿嘿

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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6楼2012-12-25 22:16:46
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tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖应助，欢迎常来晶体版 2012-12-26 08:48:08
确定是O atom? 不是其他atom type? 如果确定是O，可以参考SIMU， DELU 或 EADP 的用法。
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7楼2012-12-26 00:30:25
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tzeshyang

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖应助，欢迎常来晶体版 2012-12-26 08:48:15
会是disorder吗？可以试试， 再check一下ratio of site occupancies。
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8楼2012-12-26 00:47:29
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liuxiaocunde: 金币+10, 代发金币 2012-12-26 13:30:04
liuxiaocunde: 应助指数+1, 应助+1 2012-12-26 13:30:51
不要随便用simu ... $o 之类的命令。
      delu也不要常用。

一般这种Alert B可以不用管的。
如楼上所说，首先看看原子类型是否有搞错。
要管，可查看是否有无序。
查看是哪个氧的椭球比较大,做个裂分。
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xi2004-emuch@163.com
9楼2012-12-26 08:55:17
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563078032

木虫 (正式写手)
谢谢大家的帮忙。
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10楼2012-12-26 10:40:24
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